Protein–RNA interactions for Protein: Q3UD82

Parp8, Poly [ADP-ribose] polymerase 8, mousemouse

Predictions only

Length 852 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp8Q3UD82 Calr-201ENSMUST00000003912 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Parp8Q3UD82 Gm43372-201ENSMUST00000202662 3016 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Parp8Q3UD82 Ntrk2-207ENSMUST00000225488 4706 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Parp8Q3UD82 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Parp8Q3UD82 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Parp8Q3UD82 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Parp8Q3UD82 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Parp8Q3UD82 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Parp8Q3UD82 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Parp8Q3UD82 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Parp8Q3UD82 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Parp8Q3UD82 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Parp8Q3UD82 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Parp8Q3UD82 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Parp8Q3UD82 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Parp8Q3UD82 AC102569.1-201ENSMUST00000221563 685 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Parp8Q3UD82 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Parp8Q3UD82 Platr6-201ENSMUST00000180731 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Parp8Q3UD82 Ehd2-201ENSMUST00000098799 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Parp8Q3UD82 Scn8a-203ENSMUST00000108908 7030 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Parp8Q3UD82 Mthfd1l-203ENSMUST00000120585 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Parp8Q3UD82 Gm7598-201ENSMUST00000130251 3123 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Parp8Q3UD82 Zfp384-201ENSMUST00000046064 3108 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Parp8Q3UD82 Cacna2d4-201ENSMUST00000037434 5803 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Parp8Q3UD82 Col6a6-203ENSMUST00000166431 7098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Parp8Q3UD82 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Parp8Q3UD82 Tfap2b-204ENSMUST00000187754 3023 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Parp8Q3UD82 Spaar-201ENSMUST00000131248 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Parp8Q3UD82 Zfp964-203ENSMUST00000204285 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Parp8Q3UD82 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Parp8Q3UD82 Scnn1b-201ENSMUST00000033161 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Parp8Q3UD82 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Parp8Q3UD82 Trem1-201ENSMUST00000048782 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Parp8Q3UD82 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Parp8Q3UD82 Vcan-202ENSMUST00000109544 5702 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Parp8Q3UD82 Sec24d-201ENSMUST00000047923 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Parp8Q3UD82 Pigu-205ENSMUST00000165234 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Parp8Q3UD82 AC123738.2-201ENSMUST00000223791 1899 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Parp8Q3UD82 Ptpre-208ENSMUST00000211788 2331 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Parp8Q3UD82 Pgf-201ENSMUST00000004913 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Parp8Q3UD82 Ippk-202ENSMUST00000220447 4421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Parp8Q3UD82 Klhl7-201ENSMUST00000030841 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Parp8Q3UD82 Lsamp-201ENSMUST00000078873 2951 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Parp8Q3UD82 Ifi211-201ENSMUST00000009340 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Parp8Q3UD82 Olfr222-202ENSMUST00000214351 2474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Parp8Q3UD82 Mdm1-203ENSMUST00000164077 2922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Parp8Q3UD82 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Parp8Q3UD82 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Parp8Q3UD82 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Parp8Q3UD82 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Parp8Q3UD82 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Parp8Q3UD82 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Parp8Q3UD82 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Parp8Q3UD82 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Parp8Q3UD82 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Parp8Q3UD82 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Parp8Q3UD82 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Parp8Q3UD82 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Parp8Q3UD82 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Parp8Q3UD82 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Parp8Q3UD82 AC148334.1-201ENSMUST00000220853 370 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Parp8Q3UD82 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Parp8Q3UD82 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Parp8Q3UD82 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Parp8Q3UD82 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Parp8Q3UD82 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Parp8Q3UD82 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Parp8Q3UD82 1600014C10Rik-202ENSMUST00000165308 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Parp8Q3UD82 1600014C10Rik-204ENSMUST00000178207 3341 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Parp8Q3UD82 Hmgcll1-201ENSMUST00000008052 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Parp8Q3UD82 Ttll13-201ENSMUST00000058266 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Parp8Q3UD82 Zfp940-202ENSMUST00000108223 2560 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Parp8Q3UD82 Agrn-203ENSMUST00000105575 7262 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Parp8Q3UD82 Sgsm1-202ENSMUST00000057209 4339 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Parp8Q3UD82 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Parp8Q3UD82 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC10.4□□□□□ -0.75
Parp8Q3UD82 AC129336.1-201ENSMUST00000220224 2277 ntBASIC10.4□□□□□ -0.75
Parp8Q3UD82 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Parp8Q3UD82 Gm45041-201ENSMUST00000207366 3108 ntBASIC10.4□□□□□ -0.75
Parp8Q3UD82 Slc38a3-203ENSMUST00000177567 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Parp8Q3UD82 Gm38357-201ENSMUST00000195382 2464 ntBASIC10.4□□□□□ -0.75
Parp8Q3UD82 Golga2-203ENSMUST00000113377 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Parp8Q3UD82 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Parp8Q3UD82 8030423F21Rik-201ENSMUST00000064097 2851 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Parp8Q3UD82 Anks1b-218ENSMUST00000182595 3715 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Parp8Q3UD82 Sema4g-201ENSMUST00000026225 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Parp8Q3UD82 Ugt1a7c-201ENSMUST00000058237 3231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Parp8Q3UD82 Bco1-203ENSMUST00000176860 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Parp8Q3UD82 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Parp8Q3UD82 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Parp8Q3UD82 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Parp8Q3UD82 Vipas39-202ENSMUST00000072744 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Parp8Q3UD82 Zbtb25-202ENSMUST00000176102 2707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Parp8Q3UD82 Zer1-201ENSMUST00000044751 4100 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Parp8Q3UD82 Kirrel3-201ENSMUST00000045091 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Parp8Q3UD82 Tram2-201ENSMUST00000037998 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Parp8Q3UD82 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Parp8Q3UD82 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Parp8Q3UD82 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Parp8Q3UD82 Gm12463-201ENSMUST00000118271 849 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms