Protein–RNA interactions for Protein: G3XA52

Vmn1r34, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r34G3XA52 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vmn1r34G3XA52 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vmn1r34G3XA52 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vmn1r34G3XA52 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vmn1r34G3XA52 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vmn1r34G3XA52 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vmn1r34G3XA52 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vmn1r34G3XA52 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vmn1r34G3XA52 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vmn1r34G3XA52 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vmn1r34G3XA52 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vmn1r34G3XA52 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vmn1r34G3XA52 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Vmn1r34G3XA52 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Vmn1r34G3XA52 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vmn1r34G3XA52 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Vmn1r34G3XA52 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vmn1r34G3XA52 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Vmn1r34G3XA52 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vmn1r34G3XA52 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vmn1r34G3XA52 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vmn1r34G3XA52 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Vmn1r34G3XA52 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vmn1r34G3XA52 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vmn1r34G3XA52 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vmn1r34G3XA52 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vmn1r34G3XA52 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vmn1r34G3XA52 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Vmn1r34G3XA52 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vmn1r34G3XA52 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Vmn1r34G3XA52 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vmn1r34G3XA52 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Vmn1r34G3XA52 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vmn1r34G3XA52 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vmn1r34G3XA52 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vmn1r34G3XA52 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vmn1r34G3XA52 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vmn1r34G3XA52 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vmn1r34G3XA52 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vmn1r34G3XA52 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vmn1r34G3XA52 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vmn1r34G3XA52 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vmn1r34G3XA52 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Vmn1r34G3XA52 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vmn1r34G3XA52 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vmn1r34G3XA52 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vmn1r34G3XA52 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vmn1r34G3XA52 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vmn1r34G3XA52 Gm3139-202ENSMUST00000201138 1303 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vmn1r34G3XA52 Gm3183-203ENSMUST00000202911 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vmn1r34G3XA52 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vmn1r34G3XA52 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vmn1r34G3XA52 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vmn1r34G3XA52 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vmn1r34G3XA52 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vmn1r34G3XA52 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vmn1r34G3XA52 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vmn1r34G3XA52 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vmn1r34G3XA52 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vmn1r34G3XA52 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vmn1r34G3XA52 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vmn1r34G3XA52 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vmn1r34G3XA52 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vmn1r34G3XA52 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vmn1r34G3XA52 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vmn1r34G3XA52 Slc16a1-201ENSMUST00000046212 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Vmn1r34G3XA52 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Vmn1r34G3XA52 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Vmn1r34G3XA52 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Vmn1r34G3XA52 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Vmn1r34G3XA52 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Vmn1r34G3XA52 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Vmn1r34G3XA52 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vmn1r34G3XA52 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vmn1r34G3XA52 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vmn1r34G3XA52 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vmn1r34G3XA52 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vmn1r34G3XA52 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vmn1r34G3XA52 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vmn1r34G3XA52 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vmn1r34G3XA52 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vmn1r34G3XA52 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Vmn1r34G3XA52 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vmn1r34G3XA52 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Vmn1r34G3XA52 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vmn1r34G3XA52 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vmn1r34G3XA52 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vmn1r34G3XA52 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vmn1r34G3XA52 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Vmn1r34G3XA52 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vmn1r34G3XA52 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Vmn1r34G3XA52 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Vmn1r34G3XA52 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Vmn1r34G3XA52 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Vmn1r34G3XA52 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vmn1r34G3XA52 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vmn1r34G3XA52 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vmn1r34G3XA52 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Vmn1r34G3XA52 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vmn1r34G3XA52 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms