Protein–RNA interactions for Protein: E9QAP7

Taf4, TATA-box-binding protein-associated factor 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4E9QAP7 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Taf4E9QAP7 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Taf4E9QAP7 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Taf4E9QAP7 Myocd-203ENSMUST00000108695 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Taf4E9QAP7 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Taf4E9QAP7 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Taf4E9QAP7 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Taf4E9QAP7 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Taf4E9QAP7 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Taf4E9QAP7 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Taf4E9QAP7 Gm12798-201ENSMUST00000124786 666 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Taf4E9QAP7 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Taf4E9QAP7 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Taf4E9QAP7 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Taf4E9QAP7 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Taf4E9QAP7 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Taf4E9QAP7 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Taf4E9QAP7 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Taf4E9QAP7 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Taf4E9QAP7 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Taf4E9QAP7 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Taf4E9QAP7 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Taf4E9QAP7 Ciita-201ENSMUST00000023147 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Taf4E9QAP7 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Taf4E9QAP7 Myo15-203ENSMUST00000094135 11715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Taf4E9QAP7 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Taf4E9QAP7 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Taf4E9QAP7 Cln8-201ENSMUST00000027554 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Taf4E9QAP7 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Taf4E9QAP7 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Taf4E9QAP7 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Taf4E9QAP7 Eif3a-201ENSMUST00000025955 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Taf4E9QAP7 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Taf4E9QAP7 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Taf4E9QAP7 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Taf4E9QAP7 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Taf4E9QAP7 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Taf4E9QAP7 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Taf4E9QAP7 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Taf4E9QAP7 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Taf4E9QAP7 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Taf4E9QAP7 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Taf4E9QAP7 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Taf4E9QAP7 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Taf4E9QAP7 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Taf4E9QAP7 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Taf4E9QAP7 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Taf4E9QAP7 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC12.02□□□□□ -0.48
Taf4E9QAP7 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Taf4E9QAP7 Lrba-202ENSMUST00000192145 8843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
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Taf4E9QAP7 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
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Taf4E9QAP7 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
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Taf4E9QAP7 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Taf4E9QAP7 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
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Taf4E9QAP7 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
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Taf4E9QAP7 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Taf4E9QAP7 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Taf4E9QAP7 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Taf4E9QAP7 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Taf4E9QAP7 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
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Taf4E9QAP7 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Taf4E9QAP7 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Taf4E9QAP7 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Taf4E9QAP7 Gm38210-201ENSMUST00000191944 809 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Taf4E9QAP7 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Taf4E9QAP7 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Taf4E9QAP7 E230034D01Rik-201ENSMUST00000214440 1212 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
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