Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUN6

Smurf1, E3 ubiquitin-protein ligase SMURF1, mousemouse

Predictions only

Length 731 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smurf1Q9CUN6 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smurf1Q9CUN6 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smurf1Q9CUN6 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Smurf1Q9CUN6 Gnl2-201ENSMUST00000030684 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smurf1Q9CUN6 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smurf1Q9CUN6 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smurf1Q9CUN6 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smurf1Q9CUN6 Mknk2-201ENSMUST00000003433 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smurf1Q9CUN6 Col6a4-201ENSMUST00000121963 7371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smurf1Q9CUN6 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smurf1Q9CUN6 Gm20755-201ENSMUST00000196893 1827 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smurf1Q9CUN6 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smurf1Q9CUN6 Mageb4-201ENSMUST00000096378 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smurf1Q9CUN6 Car12-202ENSMUST00000085420 3639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smurf1Q9CUN6 Atg14-202ENSMUST00000226299 3729 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smurf1Q9CUN6 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smurf1Q9CUN6 Matn2-205ENSMUST00000227759 3569 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smurf1Q9CUN6 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smurf1Q9CUN6 Rbm47-205ENSMUST00000167950 4895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smurf1Q9CUN6 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smurf1Q9CUN6 Lysmd4-202ENSMUST00000179106 3319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smurf1Q9CUN6 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Smurf1Q9CUN6 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smurf1Q9CUN6 Prr30-202ENSMUST00000187304 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smurf1Q9CUN6 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Smurf1Q9CUN6 Tyw1-201ENSMUST00000040213 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smurf1Q9CUN6 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smurf1Q9CUN6 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Smurf1Q9CUN6 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Smurf1Q9CUN6 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smurf1Q9CUN6 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smurf1Q9CUN6 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smurf1Q9CUN6 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smurf1Q9CUN6 Gm10829-201ENSMUST00000202084 2988 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Smurf1Q9CUN6 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smurf1Q9CUN6 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smurf1Q9CUN6 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smurf1Q9CUN6 Rsrc2-202ENSMUST00000057795 2270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smurf1Q9CUN6 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smurf1Q9CUN6 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smurf1Q9CUN6 4930432K21Rik-202ENSMUST00000118856 2366 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smurf1Q9CUN6 Pcdhb2-201ENSMUST00000056522 2813 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smurf1Q9CUN6 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smurf1Q9CUN6 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smurf1Q9CUN6 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smurf1Q9CUN6 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Smurf1Q9CUN6 Akap12-202ENSMUST00000215696 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smurf1Q9CUN6 Lama4-201ENSMUST00000019992 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smurf1Q9CUN6 Zcwpw1-201ENSMUST00000035852 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smurf1Q9CUN6 Lima1-201ENSMUST00000073691 4215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smurf1Q9CUN6 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smurf1Q9CUN6 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smurf1Q9CUN6 Camk1d-201ENSMUST00000044009 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smurf1Q9CUN6 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smurf1Q9CUN6 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Smurf1Q9CUN6 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Smurf1Q9CUN6 A1cf-202ENSMUST00000224304 2968 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smurf1Q9CUN6 Kcnh7-203ENSMUST00000112454 3073 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smurf1Q9CUN6 Sipa1l2-202ENSMUST00000212168 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smurf1Q9CUN6 Kcns2-202ENSMUST00000228725 4906 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smurf1Q9CUN6 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smurf1Q9CUN6 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smurf1Q9CUN6 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smurf1Q9CUN6 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smurf1Q9CUN6 Cdhr4-211ENSMUST00000177173 2480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smurf1Q9CUN6 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smurf1Q9CUN6 Grin2b-202ENSMUST00000111905 7484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smurf1Q9CUN6 Saxo2-201ENSMUST00000056728 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smurf1Q9CUN6 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smurf1Q9CUN6 Ptpn23-201ENSMUST00000040021 5346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smurf1Q9CUN6 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smurf1Q9CUN6 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smurf1Q9CUN6 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Smurf1Q9CUN6 2010110E17Rik-201ENSMUST00000184161 879 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Smurf1Q9CUN6 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smurf1Q9CUN6 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Smurf1Q9CUN6 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Smurf1Q9CUN6 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smurf1Q9CUN6 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smurf1Q9CUN6 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smurf1Q9CUN6 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Smurf1Q9CUN6 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Smurf1Q9CUN6 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smurf1Q9CUN6 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smurf1Q9CUN6 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smurf1Q9CUN6 Fbxo43-201ENSMUST00000058643 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smurf1Q9CUN6 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smurf1Q9CUN6 Mx2-201ENSMUST00000024112 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smurf1Q9CUN6 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smurf1Q9CUN6 Chd7-206ENSMUST00000170391 3462 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smurf1Q9CUN6 Ank1-204ENSMUST00000117270 5652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smurf1Q9CUN6 Nipbl-201ENSMUST00000052965 8815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smurf1Q9CUN6 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Smurf1Q9CUN6 Igsf3-202ENSMUST00000195164 3876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smurf1Q9CUN6 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smurf1Q9CUN6 Gm9035-201ENSMUST00000218318 1697 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Smurf1Q9CUN6 Ahnak2-201ENSMUST00000101010 2821 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smurf1Q9CUN6 Sh3gl2-201ENSMUST00000030212 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smurf1Q9CUN6 Inpp4a-208ENSMUST00000137266 2934 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smurf1Q9CUN6 Chdh-202ENSMUST00000118917 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms