Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

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Length 1,454 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtprtQ99M80 Eddm3b-201ENSMUST00000100645 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtprtQ99M80 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtprtQ99M80 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtprtQ99M80 Tsc22d3-201ENSMUST00000055738 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtprtQ99M80 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtprtQ99M80 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtprtQ99M80 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtprtQ99M80 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtprtQ99M80 Gm28453-201ENSMUST00000185556 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtprtQ99M80 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtprtQ99M80 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtprtQ99M80 C130083M11Rik-201ENSMUST00000197171 2072 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtprtQ99M80 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtprtQ99M80 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtprtQ99M80 Ifna6-201ENSMUST00000105146 570 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtprtQ99M80 Mrps23-202ENSMUST00000107915 332 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtprtQ99M80 Gm6276-201ENSMUST00000120159 579 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PtprtQ99M80 Cyp2j15-ps-201ENSMUST00000122267 686 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PtprtQ99M80 Ifna11-201ENSMUST00000170428 573 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtprtQ99M80 Mrip-ps-201ENSMUST00000184613 940 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PtprtQ99M80 Gm5259-201ENSMUST00000191231 800 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PtprtQ99M80 Gm37590-201ENSMUST00000193294 603 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtprtQ99M80 Ifna1-201ENSMUST00000094972 570 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtprtQ99M80 Cyp2d41-ps-201ENSMUST00000180453 1503 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PtprtQ99M80 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtprtQ99M80 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PtprtQ99M80 Mcemp1-201ENSMUST00000014118 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtprtQ99M80 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtprtQ99M80 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtprtQ99M80 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtprtQ99M80 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtprtQ99M80 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtprtQ99M80 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtprtQ99M80 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtprtQ99M80 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtprtQ99M80 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtprtQ99M80 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PtprtQ99M80 Gm15599-201ENSMUST00000122283 1345 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PtprtQ99M80 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PtprtQ99M80 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PtprtQ99M80 Rpl10a-ps1-201ENSMUST00000120360 654 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PtprtQ99M80 Gm14650-201ENSMUST00000120400 889 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PtprtQ99M80 Gm13688-201ENSMUST00000121557 608 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PtprtQ99M80 Gm15339-201ENSMUST00000153577 506 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PtprtQ99M80 Olfr527-201ENSMUST00000172230 978 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PtprtQ99M80 Dusp3-207ENSMUST00000176261 496 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PtprtQ99M80 Gm26611-201ENSMUST00000181449 785 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PtprtQ99M80 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PtprtQ99M80 AC165260.2-201ENSMUST00000225371 395 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
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PtprtQ99M80 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PtprtQ99M80 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PtprtQ99M80 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PtprtQ99M80 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PtprtQ99M80 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PtprtQ99M80 Trim61-201ENSMUST00000078409 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PtprtQ99M80 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PtprtQ99M80 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PtprtQ99M80 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PtprtQ99M80 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PtprtQ99M80 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PtprtQ99M80 Sgcg-202ENSMUST00000121148 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PtprtQ99M80 Gm12916-201ENSMUST00000139012 948 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PtprtQ99M80 1700026D11Rik-205ENSMUST00000151417 789 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PtprtQ99M80 Slirp-202ENSMUST00000160488 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PtprtQ99M80 Gm9273-201ENSMUST00000200606 715 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PtprtQ99M80 Rarres2-203ENSMUST00000204182 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PtprtQ99M80 Fcer2a-205ENSMUST00000208145 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PtprtQ99M80 Zkscan7-205ENSMUST00000216462 990 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PtprtQ99M80 AC127583.1-201ENSMUST00000224351 540 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PtprtQ99M80 Zfp389-202ENSMUST00000224437 1234 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PtprtQ99M80 Ssna1-201ENSMUST00000028342 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PtprtQ99M80 Speer2-201ENSMUST00000076500 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
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PtprtQ99M80 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PtprtQ99M80 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PtprtQ99M80 Ccser2-203ENSMUST00000182042 1420 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PtprtQ99M80 AC116596.1-201ENSMUST00000228112 1762 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PtprtQ99M80 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PtprtQ99M80 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PtprtQ99M80 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PtprtQ99M80 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PtprtQ99M80 Gm45124-201ENSMUST00000206723 2755 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PtprtQ99M80 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PtprtQ99M80 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PtprtQ99M80 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PtprtQ99M80 Gtf2e2-203ENSMUST00000171010 1664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PtprtQ99M80 Bpifb1-202ENSMUST00000081816 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PtprtQ99M80 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PtprtQ99M80 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PtprtQ99M80 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PtprtQ99M80 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PtprtQ99M80 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PtprtQ99M80 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PtprtQ99M80 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtprtQ99M80 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtprtQ99M80 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtprtQ99M80 Msrb1-202ENSMUST00000115262 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtprtQ99M80 Gm13215-201ENSMUST00000117559 472 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms