Protein–RNA interactions for Protein: Q93088

BHMT, Betaine--homocysteine S-methyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMTQ93088 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BHMTQ93088 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BHMTQ93088 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BHMTQ93088 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BHMTQ93088 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BHMTQ93088 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BHMTQ93088 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
BHMTQ93088 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BHMTQ93088 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BHMTQ93088 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
BHMTQ93088 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BHMTQ93088 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BHMTQ93088 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BHMTQ93088 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BHMTQ93088 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BHMTQ93088 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BHMTQ93088 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BHMTQ93088 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BHMTQ93088 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
BHMTQ93088 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BHMTQ93088 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BHMTQ93088 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BHMTQ93088 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BHMTQ93088 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BHMTQ93088 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BHMTQ93088 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BHMTQ93088 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BHMTQ93088 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BHMTQ93088 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BHMTQ93088 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BHMTQ93088 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BHMTQ93088 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BHMTQ93088 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BHMTQ93088 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BHMTQ93088 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BHMTQ93088 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BHMTQ93088 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BHMTQ93088 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BHMTQ93088 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BHMTQ93088 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BHMTQ93088 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BHMTQ93088 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BHMTQ93088 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BHMTQ93088 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BHMTQ93088 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BHMTQ93088 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
BHMTQ93088 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BHMTQ93088 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
BHMTQ93088 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BHMTQ93088 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BHMTQ93088 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BHMTQ93088 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BHMTQ93088 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BHMTQ93088 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BHMTQ93088 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BHMTQ93088 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BHMTQ93088 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BHMTQ93088 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BHMTQ93088 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BHMTQ93088 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
BHMTQ93088 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BHMTQ93088 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BHMTQ93088 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BHMTQ93088 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BHMTQ93088 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BHMTQ93088 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BHMTQ93088 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BHMTQ93088 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BHMTQ93088 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BHMTQ93088 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BHMTQ93088 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BHMTQ93088 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BHMTQ93088 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BHMTQ93088 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
BHMTQ93088 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BHMTQ93088 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BHMTQ93088 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BHMTQ93088 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BHMTQ93088 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BHMTQ93088 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BHMTQ93088 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BHMTQ93088 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BHMTQ93088 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BHMTQ93088 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BHMTQ93088 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BHMTQ93088 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BHMTQ93088 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BHMTQ93088 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
BHMTQ93088 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BHMTQ93088 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BHMTQ93088 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BHMTQ93088 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
BHMTQ93088 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BHMTQ93088 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
BHMTQ93088 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
BHMTQ93088 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
BHMTQ93088 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
BHMTQ93088 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BHMTQ93088 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BHMTQ93088 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms