Protein–RNA interactions for Protein: Q78IS1

Tmed3, Transmembrane emp24 domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed3Q78IS1 Galnt16-201ENSMUST00000021558 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Tmed3Q78IS1 Gm38005-201ENSMUST00000194845 2745 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Tmed3Q78IS1 Traip-201ENSMUST00000049348 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Tmed3Q78IS1 Cstf1-201ENSMUST00000116375 3451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Tmed3Q78IS1 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Tmed3Q78IS1 Ift88-201ENSMUST00000122063 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Tmed3Q78IS1 Src-205ENSMUST00000109533 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Tmed3Q78IS1 AC122881.1-201ENSMUST00000225757 2695 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Tmed3Q78IS1 Gm21874-202ENSMUST00000190315 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Tmed3Q78IS1 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Tmed3Q78IS1 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Tmed3Q78IS1 Gm21817-201ENSMUST00000178584 2583 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Tmed3Q78IS1 Tenm2-202ENSMUST00000102801 9908 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Tmed3Q78IS1 Myo18a-201ENSMUST00000000645 7307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Tmed3Q78IS1 Rab2b-201ENSMUST00000022765 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Tmed3Q78IS1 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Tmed3Q78IS1 Zzef1-201ENSMUST00000069395 11150 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Tmed3Q78IS1 Gphn-201ENSMUST00000052472 3570 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Tmed3Q78IS1 Ank1-205ENSMUST00000117296 6794 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Tmed3Q78IS1 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Tmed3Q78IS1 A530021J07Rik-202ENSMUST00000207727 1406 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Tmed3Q78IS1 Dnm3-201ENSMUST00000070330 4601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Tmed3Q78IS1 Rorc-201ENSMUST00000029795 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Tmed3Q78IS1 Sbno2-201ENSMUST00000042771 4227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Tmed3Q78IS1 Lrrc49-204ENSMUST00000114034 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Tmed3Q78IS1 Amt-201ENSMUST00000035230 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Tmed3Q78IS1 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Tmed3Q78IS1 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Tmed3Q78IS1 Eef2k-204ENSMUST00000106489 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Tmed3Q78IS1 Alms1-201ENSMUST00000072018 9986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Tmed3Q78IS1 Rtn3-204ENSMUST00000088171 4973 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Tmed3Q78IS1 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Tmed3Q78IS1 Inpp4a-202ENSMUST00000058307 2963 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Tmed3Q78IS1 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Tmed3Q78IS1 Zc3hav1-203ENSMUST00000114900 4944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Tmed3Q78IS1 4930539E08Rik-201ENSMUST00000062357 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Tmed3Q78IS1 Slc24a1-201ENSMUST00000037798 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Tmed3Q78IS1 Tns1-201ENSMUST00000169786 9966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Tmed3Q78IS1 Olfr1349-206ENSMUST00000213656 4492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Tmed3Q78IS1 Pla2g4e-201ENSMUST00000090071 4477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Tmed3Q78IS1 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Tmed3Q78IS1 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Tmed3Q78IS1 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Tmed3Q78IS1 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Tmed3Q78IS1 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Tmed3Q78IS1 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Tmed3Q78IS1 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Tmed3Q78IS1 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Tmed3Q78IS1 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Tmed3Q78IS1 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Tmed3Q78IS1 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Tmed3Q78IS1 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Tmed3Q78IS1 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Tmed3Q78IS1 Lrrc55-201ENSMUST00000099930 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Tmed3Q78IS1 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Tmed3Q78IS1 Bcl2l11-201ENSMUST00000019281 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Tmed3Q78IS1 Sbf2-205ENSMUST00000164759 7090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Tmed3Q78IS1 Spata31d1a-201ENSMUST00000066510 4261 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Tmed3Q78IS1 Clu-201ENSMUST00000022616 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Tmed3Q78IS1 Trim36-202ENSMUST00000167364 4543 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Tmed3Q78IS1 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
Tmed3Q78IS1 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.87
Tmed3Q78IS1 Asns-202ENSMUST00000115542 2016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
Tmed3Q78IS1 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Tmed3Q78IS1 Nktr-201ENSMUST00000035112 7022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Tmed3Q78IS1 Zzef1-207ENSMUST00000172220 11249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Tmed3Q78IS1 Tsc1-204ENSMUST00000113870 7595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Tmed3Q78IS1 Slc34a2-201ENSMUST00000094787 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Tmed3Q78IS1 Gp1ba-202ENSMUST00000108551 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Tmed3Q78IS1 Vmn1r213-204ENSMUST00000228758 5975 ntAPPRIS P2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Tmed3Q78IS1 Esrp2-201ENSMUST00000115979 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Tmed3Q78IS1 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Tmed3Q78IS1 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Tmed3Q78IS1 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Tmed3Q78IS1 Hrh1-201ENSMUST00000088987 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Tmed3Q78IS1 Casq2-205ENSMUST00000165540 2434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Tmed3Q78IS1 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Tmed3Q78IS1 Atxn1l-201ENSMUST00000093162 7526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Tmed3Q78IS1 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Tmed3Q78IS1 Card14-201ENSMUST00000053245 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Tmed3Q78IS1 Slx1b-203ENSMUST00000144897 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Tmed3Q78IS1 Gm10748-202ENSMUST00000194396 2379 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Tmed3Q78IS1 Gm45889-202ENSMUST00000211255 2358 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Tmed3Q78IS1 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Tmed3Q78IS1 AC165080.1-201ENSMUST00000215257 3123 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Tmed3Q78IS1 Hemgn-201ENSMUST00000071096 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Tmed3Q78IS1 Habp2-201ENSMUST00000078284 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Tmed3Q78IS1 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Tmed3Q78IS1 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Tmed3Q78IS1 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Tmed3Q78IS1 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Tmed3Q78IS1 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Tmed3Q78IS1 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Tmed3Q78IS1 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Tmed3Q78IS1 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Tmed3Q78IS1 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Tmed3Q78IS1 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Tmed3Q78IS1 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Tmed3Q78IS1 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Tmed3Q78IS1 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.3 ms