Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT3

Fam208b, Protein FAM208B, mousemouse

Predictions only

Length 2,382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam208bQ5DTT3 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Oprm1-211ENSMUST00000105602 1366 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Zc3hc1-202ENSMUST00000102992 1865 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Gm2000-201ENSMUST00000102782 445 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Zdhhc21-202ENSMUST00000107239 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Gm13530-201ENSMUST00000134014 390 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Mrpl20-206ENSMUST00000185148 494 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Gm8197-202ENSMUST00000193422 934 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Gm43380-201ENSMUST00000200421 220 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Gm45135-201ENSMUST00000206787 1184 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Ftl1-204ENSMUST00000210864 503 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Prrg2-211ENSMUST00000211337 676 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Nutf2-202ENSMUST00000212042 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 AC158388.3-202ENSMUST00000225517 775 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Gm26670-202ENSMUST00000226862 340 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Hddc2-201ENSMUST00000000304 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Defa3-201ENSMUST00000098893 410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Oma1-201ENSMUST00000035780 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Mocs2-216ENSMUST00000184672 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Vsir-202ENSMUST00000105459 1290 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Fam3a-204ENSMUST00000114141 1243 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Mrpl24-204ENSMUST00000121920 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Gm11634-201ENSMUST00000154147 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 1700006J14Rik-204ENSMUST00000161511 574 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Calm5-202ENSMUST00000184271 423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 4933430L12Rik-201ENSMUST00000206788 1194 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Nkg7-201ENSMUST00000070518 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Gm45218-201ENSMUST00000205533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Hipk2-204ENSMUST00000160360 3907 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Src-204ENSMUST00000109531 3586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Camk2b-207ENSMUST00000101586 1590 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Platr19-201ENSMUST00000171380 1466 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 1700011M02Rik-201ENSMUST00000113602 420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Nnmt-202ENSMUST00000119426 912 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Gm12406-201ENSMUST00000155382 697 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC10.02□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Tprg-201ENSMUST00000056087 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Olfr314-201ENSMUST00000076393 1131 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Tmem134-216ENSMUST00000171743 3701 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.5 ms