Protein–RNA interactions for Protein: Q3UD82

Parp8, Poly [ADP-ribose] polymerase 8, mousemouse

Predictions only

Length 852 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp8Q3UD82 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Parp8Q3UD82 Fam53a-203ENSMUST00000065162 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Parp8Q3UD82 Pax3-201ENSMUST00000004994 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Parp8Q3UD82 Ddr1-202ENSMUST00000097333 3593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Parp8Q3UD82 Arhgef2-231ENSMUST00000177498 3966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Parp8Q3UD82 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Parp8Q3UD82 Lcorl-205ENSMUST00000121573 2378 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Parp8Q3UD82 4933408B17Rik-201ENSMUST00000056932 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Parp8Q3UD82 Dclk2-202ENSMUST00000191752 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Parp8Q3UD82 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Parp8Q3UD82 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Parp8Q3UD82 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Parp8Q3UD82 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Parp8Q3UD82 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Parp8Q3UD82 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Parp8Q3UD82 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Parp8Q3UD82 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Parp8Q3UD82 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Parp8Q3UD82 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Parp8Q3UD82 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Parp8Q3UD82 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Parp8Q3UD82 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Parp8Q3UD82 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Parp8Q3UD82 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Parp8Q3UD82 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Parp8Q3UD82 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Parp8Q3UD82 Tyw1-202ENSMUST00000044204 4698 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Parp8Q3UD82 C130013H08Rik-201ENSMUST00000197569 3692 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Parp8Q3UD82 Ilf3-202ENSMUST00000115414 3606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Parp8Q3UD82 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Parp8Q3UD82 Nr1i2-201ENSMUST00000023504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Parp8Q3UD82 Setmar-201ENSMUST00000049246 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Parp8Q3UD82 Col9a1-201ENSMUST00000054588 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Parp8Q3UD82 Gatsl2-201ENSMUST00000016088 7367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Parp8Q3UD82 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Parp8Q3UD82 Pop1-202ENSMUST00000079028 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Parp8Q3UD82 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Parp8Q3UD82 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Parp8Q3UD82 Agpat3-204ENSMUST00000105389 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Parp8Q3UD82 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Parp8Q3UD82 Nufip2-204ENSMUST00000181023 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Parp8Q3UD82 Actbl2-201ENSMUST00000054716 2737 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Parp8Q3UD82 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Parp8Q3UD82 Scamp1-203ENSMUST00000152555 1877 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Parp8Q3UD82 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Parp8Q3UD82 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Parp8Q3UD82 Gm10827-201ENSMUST00000181897 2586 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Parp8Q3UD82 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Parp8Q3UD82 Fbxo43-201ENSMUST00000058643 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Parp8Q3UD82 Rpap1-201ENSMUST00000048493 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Parp8Q3UD82 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Parp8Q3UD82 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Parp8Q3UD82 Myh1-202ENSMUST00000075734 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Parp8Q3UD82 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Parp8Q3UD82 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Parp8Q3UD82 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Parp8Q3UD82 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Parp8Q3UD82 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Parp8Q3UD82 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Parp8Q3UD82 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Parp8Q3UD82 Dhx40-201ENSMUST00000018569 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Parp8Q3UD82 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Parp8Q3UD82 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Parp8Q3UD82 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Parp8Q3UD82 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Parp8Q3UD82 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Parp8Q3UD82 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Parp8Q3UD82 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Parp8Q3UD82 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Parp8Q3UD82 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Parp8Q3UD82 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Parp8Q3UD82 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Parp8Q3UD82 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Parp8Q3UD82 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Parp8Q3UD82 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Parp8Q3UD82 Kcnip3-203ENSMUST00000103215 2732 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Parp8Q3UD82 Kcnip3-201ENSMUST00000028850 2728 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Parp8Q3UD82 A930016O22Rik-202ENSMUST00000208685 2349 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Parp8Q3UD82 Habp2-201ENSMUST00000078284 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Parp8Q3UD82 Gm5441-201ENSMUST00000186454 5181 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Parp8Q3UD82 Stat5a-202ENSMUST00000107356 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Parp8Q3UD82 Prdm1-202ENSMUST00000105490 4025 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Parp8Q3UD82 Patz1-207ENSMUST00000134089 1904 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Parp8Q3UD82 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Parp8Q3UD82 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Parp8Q3UD82 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Parp8Q3UD82 Tmem88b-201ENSMUST00000097742 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Parp8Q3UD82 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Parp8Q3UD82 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Parp8Q3UD82 Gripap1-203ENSMUST00000115675 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Parp8Q3UD82 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Parp8Q3UD82 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Parp8Q3UD82 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Parp8Q3UD82 Fga-202ENSMUST00000166581 2587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Parp8Q3UD82 A330033J07Rik-201ENSMUST00000180921 2816 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Parp8Q3UD82 AC160562.2-201ENSMUST00000216374 2201 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Parp8Q3UD82 Gm26527-201ENSMUST00000180416 1948 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Parp8Q3UD82 Sfxn5-201ENSMUST00000045846 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Parp8Q3UD82 Bbs2-201ENSMUST00000034206 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Parp8Q3UD82 Loxhd1-202ENSMUST00000096547 6595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.5 ms