Protein–RNA interactions for Protein: Q1A3B0

Cers3, Ceramide synthase 3, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cers3Q1A3B0 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cers3Q1A3B0 Akr1b8-201ENSMUST00000038406 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cers3Q1A3B0 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cers3Q1A3B0 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cers3Q1A3B0 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Cers3Q1A3B0 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cers3Q1A3B0 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cers3Q1A3B0 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cers3Q1A3B0 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cers3Q1A3B0 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cers3Q1A3B0 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cers3Q1A3B0 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cers3Q1A3B0 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cers3Q1A3B0 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cers3Q1A3B0 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cers3Q1A3B0 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cers3Q1A3B0 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cers3Q1A3B0 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cers3Q1A3B0 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cers3Q1A3B0 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cers3Q1A3B0 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cers3Q1A3B0 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cers3Q1A3B0 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cers3Q1A3B0 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cers3Q1A3B0 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cers3Q1A3B0 Evi2a-201ENSMUST00000103236 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cers3Q1A3B0 Ighv10-3-201ENSMUST00000103495 377 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cers3Q1A3B0 S100a4-201ENSMUST00000001046 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cers3Q1A3B0 Acrbp-204ENSMUST00000112413 672 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cers3Q1A3B0 Csf1-204ENSMUST00000120654 821 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cers3Q1A3B0 Gm14275-201ENSMUST00000152112 430 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cers3Q1A3B0 Gm15744-201ENSMUST00000161734 213 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Cers3Q1A3B0 Gm43552-201ENSMUST00000196121 365 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cers3Q1A3B0 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cers3Q1A3B0 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Cers3Q1A3B0 Gm45758-201ENSMUST00000212448 1006 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Cers3Q1A3B0 Gm4065-201ENSMUST00000218715 763 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cers3Q1A3B0 AC099645.1-201ENSMUST00000226476 1105 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Cers3Q1A3B0 Lgi3-203ENSMUST00000226548 1001 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Cers3Q1A3B0 Nop10-201ENSMUST00000028553 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cers3Q1A3B0 Rpl3l-201ENSMUST00000045186 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cers3Q1A3B0 Krtap4-2-201ENSMUST00000058987 974 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cers3Q1A3B0 Taar8b-201ENSMUST00000092654 1035 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cers3Q1A3B0 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cers3Q1A3B0 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cers3Q1A3B0 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cers3Q1A3B0 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cers3Q1A3B0 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Cers3Q1A3B0 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cers3Q1A3B0 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cers3Q1A3B0 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cers3Q1A3B0 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cers3Q1A3B0 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cers3Q1A3B0 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cers3Q1A3B0 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cers3Q1A3B0 Aurkc-203ENSMUST00000207711 1320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cers3Q1A3B0 Foxh1-201ENSMUST00000037824 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cers3Q1A3B0 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cers3Q1A3B0 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cers3Q1A3B0 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cers3Q1A3B0 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cers3Q1A3B0 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cers3Q1A3B0 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cers3Q1A3B0 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cers3Q1A3B0 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cers3Q1A3B0 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cers3Q1A3B0 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cers3Q1A3B0 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cers3Q1A3B0 Gm37368-201ENSMUST00000193173 3212 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cers3Q1A3B0 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cers3Q1A3B0 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cers3Q1A3B0 Gm25063-201ENSMUST00000104666 94 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cers3Q1A3B0 Gm8302-201ENSMUST00000119217 852 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cers3Q1A3B0 Tbata-203ENSMUST00000121297 1000 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cers3Q1A3B0 Gm10169-201ENSMUST00000121822 348 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cers3Q1A3B0 Gm16323-201ENSMUST00000134920 556 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cers3Q1A3B0 Nr5a1os-201ENSMUST00000146954 926 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cers3Q1A3B0 Gm20400-201ENSMUST00000173695 665 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cers3Q1A3B0 Rn7s6-201ENSMUST00000175005 291 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cers3Q1A3B0 Gm6407-201ENSMUST00000176468 549 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cers3Q1A3B0 Mir6407-201ENSMUST00000184510 101 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cers3Q1A3B0 Gm28836-201ENSMUST00000185842 633 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cers3Q1A3B0 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cers3Q1A3B0 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cers3Q1A3B0 Gm37284-201ENSMUST00000193607 539 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cers3Q1A3B0 Gm37800-202ENSMUST00000193667 553 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cers3Q1A3B0 Gm37826-201ENSMUST00000195329 322 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cers3Q1A3B0 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cers3Q1A3B0 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cers3Q1A3B0 Gng8-202ENSMUST00000205459 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cers3Q1A3B0 Gm17825-201ENSMUST00000206836 794 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cers3Q1A3B0 Gm11634-202ENSMUST00000209862 573 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cers3Q1A3B0 Gm2174-201ENSMUST00000079663 402 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cers3Q1A3B0 Gm10263-201ENSMUST00000085163 300 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cers3Q1A3B0 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cers3Q1A3B0 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cers3Q1A3B0 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cers3Q1A3B0 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cers3Q1A3B0 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cers3Q1A3B0 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.5 ms