Protein–RNA interactions for Protein: Q07002

CDK18, Cyclin-dependent kinase 18, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK18Q07002 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CDK18Q07002 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDK18Q07002 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CDK18Q07002 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDK18Q07002 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDK18Q07002 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
CDK18Q07002 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CDK18Q07002 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CDK18Q07002 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CDK18Q07002 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDK18Q07002 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDK18Q07002 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CDK18Q07002 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CDK18Q07002 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDK18Q07002 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDK18Q07002 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDK18Q07002 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CDK18Q07002 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CDK18Q07002 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDK18Q07002 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CDK18Q07002 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CDK18Q07002 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDK18Q07002 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDK18Q07002 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CDK18Q07002 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDK18Q07002 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CDK18Q07002 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDK18Q07002 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CDK18Q07002 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDK18Q07002 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDK18Q07002 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
CDK18Q07002 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CDK18Q07002 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CDK18Q07002 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CDK18Q07002 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CDK18Q07002 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDK18Q07002 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CDK18Q07002 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDK18Q07002 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDK18Q07002 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDK18Q07002 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDK18Q07002 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDK18Q07002 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CDK18Q07002 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CDK18Q07002 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CDK18Q07002 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CDK18Q07002 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDK18Q07002 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDK18Q07002 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDK18Q07002 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CDK18Q07002 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CDK18Q07002 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDK18Q07002 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDK18Q07002 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDK18Q07002 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CDK18Q07002 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CDK18Q07002 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CDK18Q07002 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CDK18Q07002 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
CDK18Q07002 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CDK18Q07002 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CDK18Q07002 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CDK18Q07002 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CDK18Q07002 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CDK18Q07002 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CDK18Q07002 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CDK18Q07002 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CDK18Q07002 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CDK18Q07002 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CDK18Q07002 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CDK18Q07002 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CDK18Q07002 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CDK18Q07002 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CDK18Q07002 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CDK18Q07002 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CDK18Q07002 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CDK18Q07002 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CDK18Q07002 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CDK18Q07002 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CDK18Q07002 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CDK18Q07002 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CDK18Q07002 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CDK18Q07002 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CDK18Q07002 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CDK18Q07002 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CDK18Q07002 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
CDK18Q07002 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CDK18Q07002 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CDK18Q07002 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CDK18Q07002 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CDK18Q07002 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CDK18Q07002 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CDK18Q07002 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CDK18Q07002 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CDK18Q07002 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CDK18Q07002 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CDK18Q07002 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CDK18Q07002 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CDK18Q07002 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CDK18Q07002 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms