Protein–RNA interactions for Protein: Q00623

Apoa1, Apolipoprotein A-I, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa1Q00623 Cyp2s1-202ENSMUST00000108395 3161 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Apoa1Q00623 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Apoa1Q00623 Gm19299-202ENSMUST00000215724 1435 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Apoa1Q00623 Slitrk3-202ENSMUST00000192477 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Apoa1Q00623 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Apoa1Q00623 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Apoa1Q00623 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Apoa1Q00623 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Apoa1Q00623 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Apoa1Q00623 Olfr46-203ENSMUST00000214180 7750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Apoa1Q00623 Pou1f1-201ENSMUST00000004964 1773 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Apoa1Q00623 4632404M16Rik-201ENSMUST00000197326 2882 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Apoa1Q00623 Enpp4-201ENSMUST00000024757 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Apoa1Q00623 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Apoa1Q00623 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Apoa1Q00623 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Apoa1Q00623 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Apoa1Q00623 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Apoa1Q00623 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Apoa1Q00623 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Apoa1Q00623 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Apoa1Q00623 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Apoa1Q00623 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Apoa1Q00623 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Apoa1Q00623 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Apoa1Q00623 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Apoa1Q00623 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Apoa1Q00623 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Apoa1Q00623 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Apoa1Q00623 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Apoa1Q00623 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Apoa1Q00623 Col5a2-201ENSMUST00000086430 6625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Apoa1Q00623 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Apoa1Q00623 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Apoa1Q00623 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Apoa1Q00623 Map3k12-208ENSMUST00000171565 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Apoa1Q00623 Asb1-201ENSMUST00000027538 5826 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Apoa1Q00623 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Apoa1Q00623 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Apoa1Q00623 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Apoa1Q00623 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Apoa1Q00623 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Apoa1Q00623 Casc1-203ENSMUST00000111728 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Apoa1Q00623 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Apoa1Q00623 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Apoa1Q00623 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Apoa1Q00623 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Apoa1Q00623 Tyw1-202ENSMUST00000044204 4698 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Apoa1Q00623 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Apoa1Q00623 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Apoa1Q00623 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Apoa1Q00623 Zmynd11-203ENSMUST00000110634 3824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Apoa1Q00623 Scrn1-201ENSMUST00000019268 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Apoa1Q00623 Klhl3-201ENSMUST00000091583 6871 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Apoa1Q00623 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Apoa1Q00623 Gm37613-201ENSMUST00000195677 3580 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Apoa1Q00623 Ing1-204ENSMUST00000210041 1881 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Apoa1Q00623 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Apoa1Q00623 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Apoa1Q00623 9230105E05Rik-201ENSMUST00000161291 2250 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Apoa1Q00623 Krt7-201ENSMUST00000068904 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Apoa1Q00623 Trpv1-203ENSMUST00000108470 2667 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Apoa1Q00623 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Apoa1Q00623 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Apoa1Q00623 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Apoa1Q00623 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Apoa1Q00623 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Apoa1Q00623 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Apoa1Q00623 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Apoa1Q00623 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Apoa1Q00623 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Apoa1Q00623 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Apoa1Q00623 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Apoa1Q00623 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Apoa1Q00623 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Apoa1Q00623 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Apoa1Q00623 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Apoa1Q00623 Tbc1d14-202ENSMUST00000124036 2765 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Apoa1Q00623 Pck2-207ENSMUST00000226519 4625 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Apoa1Q00623 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Apoa1Q00623 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Apoa1Q00623 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Apoa1Q00623 Gm5441-201ENSMUST00000186454 5181 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Apoa1Q00623 Iqce-201ENSMUST00000041783 6037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Apoa1Q00623 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Apoa1Q00623 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Apoa1Q00623 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Apoa1Q00623 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Apoa1Q00623 Ccdc57-201ENSMUST00000056781 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Apoa1Q00623 Asb8-204ENSMUST00000143400 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Apoa1Q00623 Hsd3b6-201ENSMUST00000029463 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Apoa1Q00623 Kalrn-205ENSMUST00000114953 4722 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Apoa1Q00623 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Apoa1Q00623 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Apoa1Q00623 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Apoa1Q00623 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Apoa1Q00623 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Apoa1Q00623 Myo5a-206ENSMUST00000136731 6480 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Apoa1Q00623 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Apoa1Q00623 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.6 ms