Protein–RNA interactions for Protein: Q00288

Pax8, Paired box protein Pax-8, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax8Q00288 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC9.9□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.1 ms