Protein–RNA interactions for Protein: P56473

Agrp, Agouti-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AgrpP56473 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
AgrpP56473 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
AgrpP56473 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
AgrpP56473 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
AgrpP56473 Olfr22-ps1-201ENSMUST00000115991 1237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
AgrpP56473 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
AgrpP56473 Gm16397-201ENSMUST00000122201 494 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
AgrpP56473 Gm15856-201ENSMUST00000124853 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
AgrpP56473 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
AgrpP56473 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
AgrpP56473 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
AgrpP56473 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
AgrpP56473 Gm28215-201ENSMUST00000186146 346 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
AgrpP56473 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
AgrpP56473 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
AgrpP56473 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
AgrpP56473 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
AgrpP56473 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
AgrpP56473 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
AgrpP56473 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
AgrpP56473 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
AgrpP56473 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
AgrpP56473 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
AgrpP56473 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
AgrpP56473 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
AgrpP56473 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
AgrpP56473 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
AgrpP56473 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
AgrpP56473 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
AgrpP56473 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
AgrpP56473 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
AgrpP56473 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
AgrpP56473 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
AgrpP56473 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
AgrpP56473 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
AgrpP56473 Carns1-201ENSMUST00000167055 3968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
AgrpP56473 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
AgrpP56473 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
AgrpP56473 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
AgrpP56473 Zfp236-202ENSMUST00000182122 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
AgrpP56473 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
AgrpP56473 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
AgrpP56473 Wbp1l-204ENSMUST00000138302 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
AgrpP56473 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
AgrpP56473 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
AgrpP56473 Sema4d-201ENSMUST00000021900 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
AgrpP56473 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
AgrpP56473 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
AgrpP56473 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
AgrpP56473 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
AgrpP56473 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
AgrpP56473 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
AgrpP56473 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
AgrpP56473 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
AgrpP56473 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
AgrpP56473 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
AgrpP56473 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
AgrpP56473 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
AgrpP56473 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
AgrpP56473 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
AgrpP56473 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
AgrpP56473 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
AgrpP56473 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
AgrpP56473 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
AgrpP56473 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
AgrpP56473 Gm6485-201ENSMUST00000160676 439 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
AgrpP56473 H1foo-203ENSMUST00000161969 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
AgrpP56473 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
AgrpP56473 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
AgrpP56473 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
AgrpP56473 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
AgrpP56473 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
AgrpP56473 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
AgrpP56473 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
AgrpP56473 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
AgrpP56473 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
AgrpP56473 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
AgrpP56473 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
AgrpP56473 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
AgrpP56473 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
AgrpP56473 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
AgrpP56473 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
AgrpP56473 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
AgrpP56473 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
AgrpP56473 Slc7a1-201ENSMUST00000048116 7179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
AgrpP56473 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
AgrpP56473 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
AgrpP56473 Phf21a-202ENSMUST00000068702 6023 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
AgrpP56473 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
AgrpP56473 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
AgrpP56473 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
AgrpP56473 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
AgrpP56473 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
AgrpP56473 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
AgrpP56473 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
AgrpP56473 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
AgrpP56473 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
AgrpP56473 Fn1-203ENSMUST00000186129 7797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
AgrpP56473 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
AgrpP56473 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms