Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxd10P28359 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxd10P28359 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxd10P28359 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxd10P28359 Nrf1-220ENSMUST00000170535 1527 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxd10P28359 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxd10P28359 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxd10P28359 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxd10P28359 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxd10P28359 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxd10P28359 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxd10P28359 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxd10P28359 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxd10P28359 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxd10P28359 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxd10P28359 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxd10P28359 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxd10P28359 Unc119-202ENSMUST00000100755 933 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxd10P28359 Ankrd7-202ENSMUST00000115396 1157 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Hoxd10P28359 Csf1-204ENSMUST00000120654 821 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxd10P28359 Gm4903-201ENSMUST00000210462 405 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxd10P28359 Gm36176-201ENSMUST00000218749 501 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxd10P28359 Capsl-202ENSMUST00000226688 739 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxd10P28359 Hddc2-201ENSMUST00000000304 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxd10P28359 Mrps11-201ENSMUST00000032840 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxd10P28359 Lsm3-201ENSMUST00000040607 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxd10P28359 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxd10P28359 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxd10P28359 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxd10P28359 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxd10P28359 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxd10P28359 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxd10P28359 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxd10P28359 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxd10P28359 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxd10P28359 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxd10P28359 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxd10P28359 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxd10P28359 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Hoxd10P28359 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxd10P28359 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxd10P28359 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxd10P28359 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxd10P28359 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Hoxd10P28359 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxd10P28359 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Hoxd10P28359 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxd10P28359 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Hoxd10P28359 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Hoxd10P28359 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxd10P28359 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxd10P28359 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Hoxd10P28359 Eef1akmt1-201ENSMUST00000022518 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxd10P28359 Gm7735-201ENSMUST00000089098 159 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxd10P28359 Olfr372-201ENSMUST00000093434 1016 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxd10P28359 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxd10P28359 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxd10P28359 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxd10P28359 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxd10P28359 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxd10P28359 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxd10P28359 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxd10P28359 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxd10P28359 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxd10P28359 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxd10P28359 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxd10P28359 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxd10P28359 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxd10P28359 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxd10P28359 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxd10P28359 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxd10P28359 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxd10P28359 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxd10P28359 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxd10P28359 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
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