Protein–RNA interactions for Protein: P21952

Pou3f1, POU domain, class 3, transcription factor 1, mousemouse

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Length 449 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou3f1P21952 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pou3f1P21952 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pou3f1P21952 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Pou3f1P21952 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pou3f1P21952 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pou3f1P21952 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pou3f1P21952 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pou3f1P21952 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pou3f1P21952 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pou3f1P21952 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pou3f1P21952 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Pou3f1P21952 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pou3f1P21952 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pou3f1P21952 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pou3f1P21952 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pou3f1P21952 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pou3f1P21952 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pou3f1P21952 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pou3f1P21952 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pou3f1P21952 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pou3f1P21952 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pou3f1P21952 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pou3f1P21952 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pou3f1P21952 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Pou3f1P21952 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Pou3f1P21952 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pou3f1P21952 Gm15567-201ENSMUST00000148699 2130 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pou3f1P21952 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pou3f1P21952 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pou3f1P21952 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Pou3f1P21952 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Pou3f1P21952 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pou3f1P21952 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pou3f1P21952 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pou3f1P21952 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pou3f1P21952 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pou3f1P21952 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pou3f1P21952 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pou3f1P21952 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pou3f1P21952 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pou3f1P21952 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pou3f1P21952 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pou3f1P21952 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pou3f1P21952 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pou3f1P21952 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pou3f1P21952 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pou3f1P21952 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pou3f1P21952 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Pou3f1P21952 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pou3f1P21952 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pou3f1P21952 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pou3f1P21952 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pou3f1P21952 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pou3f1P21952 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pou3f1P21952 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pou3f1P21952 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pou3f1P21952 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Pou3f1P21952 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pou3f1P21952 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pou3f1P21952 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pou3f1P21952 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pou3f1P21952 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pou3f1P21952 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pou3f1P21952 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pou3f1P21952 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Pou3f1P21952 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pou3f1P21952 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pou3f1P21952 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pou3f1P21952 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pou3f1P21952 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pou3f1P21952 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pou3f1P21952 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pou3f1P21952 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pou3f1P21952 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pou3f1P21952 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Pou3f1P21952 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Pou3f1P21952 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pou3f1P21952 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Pou3f1P21952 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Pou3f1P21952 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Pou3f1P21952 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pou3f1P21952 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pou3f1P21952 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pou3f1P21952 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pou3f1P21952 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pou3f1P21952 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Pou3f1P21952 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pou3f1P21952 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pou3f1P21952 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pou3f1P21952 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Pou3f1P21952 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Pou3f1P21952 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pou3f1P21952 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pou3f1P21952 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pou3f1P21952 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pou3f1P21952 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pou3f1P21952 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pou3f1P21952 Gon4l-203ENSMUST00000107498 7537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pou3f1P21952 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pou3f1P21952 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
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