Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Acot11-202ENSMUST00000102762 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Gm37333-201ENSMUST00000192904 2251 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Ppp1r12a-205ENSMUST00000219263 3355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Il9r-205ENSMUST00000145401 4482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Ctnnd1-205ENSMUST00000111670 5047 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Adgrl3-217ENSMUST00000121707 6690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Dync1h1-201ENSMUST00000018851 14342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Tmem184a-202ENSMUST00000110832 4326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Snx31-203ENSMUST00000161202 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Fhdc1-201ENSMUST00000091002 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Gm26737-201ENSMUST00000181106 2151 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Tmem130-201ENSMUST00000061446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Syn2-202ENSMUST00000169345 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Pbld1-202ENSMUST00000178684 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Tmem92-201ENSMUST00000100554 2043 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 9230105E05Rik-201ENSMUST00000161291 2250 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Zfp114-203ENSMUST00000206547 3154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Arhgap24-202ENSMUST00000073302 3151 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Peg10-203ENSMUST00000176551 6567 ntTSL 2 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Gm5766-201ENSMUST00000160520 1977 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Ctnnd1-223ENSMUST00000111697 5294 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Plec-217ENSMUST00000169438 14827 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Rpap1-201ENSMUST00000048493 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Gpr101-201ENSMUST00000057645 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Cyp26b1-205ENSMUST00000205228 4288 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.7 ms