Protein–RNA interactions for Protein: B4XVP9

Phf11c, PHD finger protein 11C, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11cB4XVP9 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Phf11cB4XVP9 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Phf11cB4XVP9 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Phf11cB4XVP9 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Phf11cB4XVP9 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Phf11cB4XVP9 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Phf11cB4XVP9 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Phf11cB4XVP9 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Phf11cB4XVP9 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Phf11cB4XVP9 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Phf11cB4XVP9 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Phf11cB4XVP9 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Phf11cB4XVP9 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Phf11cB4XVP9 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Phf11cB4XVP9 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Phf11cB4XVP9 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Phf11cB4XVP9 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Phf11cB4XVP9 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Phf11cB4XVP9 Gm43937-201ENSMUST00000204640 3122 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Phf11cB4XVP9 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC11□□□□□ -0.65
Phf11cB4XVP9 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Phf11cB4XVP9 Ctcfl-202ENSMUST00000179693 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Phf11cB4XVP9 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Phf11cB4XVP9 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Phf11cB4XVP9 Rxfp2-206ENSMUST00000201612 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Phf11cB4XVP9 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Phf11cB4XVP9 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Phf11cB4XVP9 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Phf11cB4XVP9 Ptpru-202ENSMUST00000097860 3365 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Phf11cB4XVP9 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Phf11cB4XVP9 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Phf11cB4XVP9 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Phf11cB4XVP9 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Phf11cB4XVP9 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Phf11cB4XVP9 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Phf11cB4XVP9 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Phf11cB4XVP9 Rad51ap2-201ENSMUST00000124065 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Phf11cB4XVP9 Esr2-205ENSMUST00000218621 3342 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Phf11cB4XVP9 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Phf11cB4XVP9 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Phf11cB4XVP9 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Phf11cB4XVP9 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Phf11cB4XVP9 Col20a1-201ENSMUST00000108856 4489 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Phf11cB4XVP9 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Phf11cB4XVP9 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Phf11cB4XVP9 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Phf11cB4XVP9 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Phf11cB4XVP9 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Phf11cB4XVP9 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Phf11cB4XVP9 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Phf11cB4XVP9 Aar2-202ENSMUST00000109570 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Phf11cB4XVP9 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Phf11cB4XVP9 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Phf11cB4XVP9 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Phf11cB4XVP9 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Phf11cB4XVP9 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Phf11cB4XVP9 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Phf11cB4XVP9 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Phf11cB4XVP9 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Phf11cB4XVP9 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Phf11cB4XVP9 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Phf11cB4XVP9 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Phf11cB4XVP9 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Phf11cB4XVP9 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Phf11cB4XVP9 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Phf11cB4XVP9 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Phf11cB4XVP9 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Phf11cB4XVP9 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Phf11cB4XVP9 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Phf11cB4XVP9 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Phf11cB4XVP9 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Phf11cB4XVP9 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Phf11cB4XVP9 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Phf11cB4XVP9 Ikbkb-202ENSMUST00000063401 3977 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Phf11cB4XVP9 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Phf11cB4XVP9 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Phf11cB4XVP9 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Phf11cB4XVP9 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Phf11cB4XVP9 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Phf11cB4XVP9 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Phf11cB4XVP9 Tcof1-204ENSMUST00000176630 4529 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Phf11cB4XVP9 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Phf11cB4XVP9 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Phf11cB4XVP9 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Phf11cB4XVP9 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Phf11cB4XVP9 Furin-201ENSMUST00000107362 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Phf11cB4XVP9 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Phf11cB4XVP9 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Phf11cB4XVP9 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Phf11cB4XVP9 1700017B05Rik-202ENSMUST00000213199 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Phf11cB4XVP9 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Phf11cB4XVP9 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Phf11cB4XVP9 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Phf11cB4XVP9 Dync1i2-201ENSMUST00000081710 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Phf11cB4XVP9 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Phf11cB4XVP9 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Phf11cB4XVP9 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Phf11cB4XVP9 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Phf11cB4XVP9 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Phf11cB4XVP9 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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