Protein–RNA interactions for Protein: A3KG45

Gm6880, MCG1035527 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6880A3KG45 E130307A14Rik-203ENSMUST00000136862 608 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm6880A3KG45 Gm13703-201ENSMUST00000150705 449 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm6880A3KG45 Gm13236-201ENSMUST00000153010 940 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm6880A3KG45 Rnf181-212ENSMUST00000154098 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm6880A3KG45 Mir6407-201ENSMUST00000184510 101 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm6880A3KG45 Gm43695-201ENSMUST00000196545 196 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm6880A3KG45 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm6880A3KG45 Mrpl23-206ENSMUST00000210662 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm6880A3KG45 CT030170.2-201ENSMUST00000223267 126 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm6880A3KG45 AC154176.1-201ENSMUST00000225897 220 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm6880A3KG45 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm6880A3KG45 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm6880A3KG45 Gm25201-201ENSMUST00000083093 170 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm6880A3KG45 Taar8b-201ENSMUST00000092654 1035 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm6880A3KG45 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm6880A3KG45 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm6880A3KG45 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm6880A3KG45 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm6880A3KG45 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm6880A3KG45 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm6880A3KG45 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm6880A3KG45 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Gm6880A3KG45 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Gm6880A3KG45 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Gm6880A3KG45 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Gm6880A3KG45 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Gm6880A3KG45 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Gm6880A3KG45 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm6880A3KG45 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm6880A3KG45 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm6880A3KG45 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm6880A3KG45 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm6880A3KG45 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm6880A3KG45 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm6880A3KG45 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm6880A3KG45 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm6880A3KG45 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm6880A3KG45 Gm10479-201ENSMUST00000101568 318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm6880A3KG45 Krtap4-9-201ENSMUST00000105059 1059 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm6880A3KG45 Gm13117-201ENSMUST00000120894 691 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm6880A3KG45 Gm11789-203ENSMUST00000140645 737 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm6880A3KG45 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm6880A3KG45 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm6880A3KG45 Rbp2-202ENSMUST00000187905 611 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm6880A3KG45 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm6880A3KG45 Gm42816-201ENSMUST00000198433 325 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm6880A3KG45 Olfr335-ps-201ENSMUST00000223545 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm6880A3KG45 Them5-201ENSMUST00000029794 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm6880A3KG45 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm6880A3KG45 Gm4744-201ENSMUST00000073642 792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm6880A3KG45 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm6880A3KG45 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm6880A3KG45 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm6880A3KG45 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm6880A3KG45 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm6880A3KG45 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm6880A3KG45 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm6880A3KG45 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm6880A3KG45 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm6880A3KG45 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm6880A3KG45 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm6880A3KG45 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm6880A3KG45 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm6880A3KG45 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm6880A3KG45 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm6880A3KG45 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm6880A3KG45 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm6880A3KG45 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm6880A3KG45 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm6880A3KG45 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm6880A3KG45 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm6880A3KG45 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm6880A3KG45 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm6880A3KG45 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm6880A3KG45 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm6880A3KG45 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm6880A3KG45 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm6880A3KG45 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm6880A3KG45 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm6880A3KG45 Gm11801-201ENSMUST00000117807 746 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm6880A3KG45 n-R5s84-201ENSMUST00000122591 109 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm6880A3KG45 Bach2it1-201ENSMUST00000133451 481 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm6880A3KG45 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm6880A3KG45 Gm14275-201ENSMUST00000152112 430 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm6880A3KG45 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm6880A3KG45 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm6880A3KG45 Rpain-201ENSMUST00000018593 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm6880A3KG45 1700008A23Rik-201ENSMUST00000191694 691 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm6880A3KG45 Gm35025-203ENSMUST00000193519 634 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm6880A3KG45 Gm37826-201ENSMUST00000195329 322 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm6880A3KG45 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm6880A3KG45 Gm3726-201ENSMUST00000203110 785 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm6880A3KG45 Gm8436-201ENSMUST00000210152 1080 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm6880A3KG45 Gm5749-201ENSMUST00000210673 1090 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm6880A3KG45 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm6880A3KG45 Gm4065-202ENSMUST00000218911 986 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm6880A3KG45 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm6880A3KG45 AC129308.3-201ENSMUST00000225652 524 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm6880A3KG45 Higd2a-201ENSMUST00000026986 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm6880A3KG45 Gbgt1-201ENSMUST00000028172 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms