Protein–RNA interactions for Protein: Q99M08

Uncharacterized protein C4orf3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 65 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q99M08 Robo1-201ENSMUST00000023600 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Q99M08 Nmt1-201ENSMUST00000021314 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Q99M08 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Q99M08 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Q99M08 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Q99M08 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Q99M08 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Q99M08 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Q99M08 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Q99M08 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Q99M08 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Q99M08 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Q99M08 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
Q99M08 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Q99M08 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Q99M08 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Q99M08 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Q99M08 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
Q99M08 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Q99M08 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Q99M08 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Q99M08 Ehd2-201ENSMUST00000098799 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Q99M08 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Q99M08 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Q99M08 Gm29895-201ENSMUST00000209933 5652 ntTSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Q99M08 Ciita-201ENSMUST00000023147 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Q99M08 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Q99M08 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Q99M08 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Q99M08 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Q99M08 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Q99M08 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Q99M08 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Q99M08 Acsl4-201ENSMUST00000033634 5280 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Q99M08 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Q99M08 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Q99M08 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Q99M08 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
Q99M08 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
Q99M08 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Q99M08 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
Q99M08 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Q99M08 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Q99M08 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Q99M08 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
Q99M08 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
Q99M08 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Q99M08 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
Q99M08 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
Q99M08 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Q99M08 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Q99M08 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Q99M08 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Q99M08 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Q99M08 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Q99M08 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Q99M08 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Q99M08 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Q99M08 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Q99M08 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Q99M08 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Q99M08 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Q99M08 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
Q99M08 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Q99M08 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
Q99M08 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Q99M08 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Q99M08 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Q99M08 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Q99M08 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Q99M08 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Q99M08 Camk2a-203ENSMUST00000102888 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Q99M08 Prrx1-201ENSMUST00000027878 4952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Q99M08 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Q99M08 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Q99M08 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Q99M08 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Q99M08 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Q99M08 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Q99M08 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Q99M08 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Q99M08 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Q99M08 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Q99M08 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Q99M08 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Q99M08 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Q99M08 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Q99M08 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Q99M08 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Q99M08 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Q99M08 Ctnnd1-204ENSMUST00000099941 5783 ntTSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Q99M08 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Q99M08 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Q99M08 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Q99M08 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Q99M08 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Q99M08 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Q99M08 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Q99M08 Gpr146-203ENSMUST00000100514 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Q99M08 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms