Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ78

Znf628, Zinc finger protein 628, mousemouse

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Length 1,038 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf628Q8CJ78 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
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Znf628Q8CJ78 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Znf628Q8CJ78 Gm10135-201ENSMUST00000043711 252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Znf628Q8CJ78 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Znf628Q8CJ78 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
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Znf628Q8CJ78 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Znf628Q8CJ78 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Znf628Q8CJ78 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Znf628Q8CJ78 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
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Znf628Q8CJ78 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Znf628Q8CJ78 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
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Znf628Q8CJ78 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
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Znf628Q8CJ78 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Znf628Q8CJ78 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Znf628Q8CJ78 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Znf628Q8CJ78 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Znf628Q8CJ78 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
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Znf628Q8CJ78 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Znf628Q8CJ78 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
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Znf628Q8CJ78 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Znf628Q8CJ78 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
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Znf628Q8CJ78 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
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Znf628Q8CJ78 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Znf628Q8CJ78 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
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Znf628Q8CJ78 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Znf628Q8CJ78 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Znf628Q8CJ78 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
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Znf628Q8CJ78 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Znf628Q8CJ78 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Znf628Q8CJ78 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Znf628Q8CJ78 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Znf628Q8CJ78 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Znf628Q8CJ78 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Znf628Q8CJ78 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Znf628Q8CJ78 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Znf628Q8CJ78 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Znf628Q8CJ78 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Znf628Q8CJ78 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Znf628Q8CJ78 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Znf628Q8CJ78 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Znf628Q8CJ78 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Znf628Q8CJ78 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Znf628Q8CJ78 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Znf628Q8CJ78 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms