Protein–RNA interactions for Protein: Q8CB62

Cntrob, Centrobin, mousemouse

Predictions only

Length 887 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CntrobQ8CB62 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
CntrobQ8CB62 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
CntrobQ8CB62 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
CntrobQ8CB62 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
CntrobQ8CB62 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
CntrobQ8CB62 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
CntrobQ8CB62 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
CntrobQ8CB62 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
CntrobQ8CB62 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
CntrobQ8CB62 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
CntrobQ8CB62 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
CntrobQ8CB62 Tcp10a-202ENSMUST00000128533 2589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
CntrobQ8CB62 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
CntrobQ8CB62 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
CntrobQ8CB62 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
CntrobQ8CB62 Nrip3-201ENSMUST00000033331 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
CntrobQ8CB62 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
CntrobQ8CB62 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
CntrobQ8CB62 Gm8320-201ENSMUST00000177584 1762 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
CntrobQ8CB62 Gm8303-201ENSMUST00000178371 1762 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
CntrobQ8CB62 Gm8331-201ENSMUST00000178433 1762 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
CntrobQ8CB62 Slitrk3-202ENSMUST00000192477 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
CntrobQ8CB62 Satb1-207ENSMUST00000140979 3748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
CntrobQ8CB62 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
CntrobQ8CB62 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
CntrobQ8CB62 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
CntrobQ8CB62 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
CntrobQ8CB62 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
CntrobQ8CB62 Wdr78-203ENSMUST00000106868 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
CntrobQ8CB62 Ankrd52-201ENSMUST00000014642 6620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
CntrobQ8CB62 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
CntrobQ8CB62 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
CntrobQ8CB62 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
CntrobQ8CB62 Nek4-207ENSMUST00000228328 4245 ntAPPRIS P2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
CntrobQ8CB62 Gal3st4-201ENSMUST00000100530 3162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
CntrobQ8CB62 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
CntrobQ8CB62 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
CntrobQ8CB62 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
CntrobQ8CB62 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
CntrobQ8CB62 Tacc2-217ENSMUST00000209108 3310 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
CntrobQ8CB62 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
CntrobQ8CB62 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
CntrobQ8CB62 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
CntrobQ8CB62 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
CntrobQ8CB62 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
CntrobQ8CB62 Gm40617-201ENSMUST00000218840 2420 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
CntrobQ8CB62 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
CntrobQ8CB62 Mid1-214ENSMUST00000163810 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
CntrobQ8CB62 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
CntrobQ8CB62 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
CntrobQ8CB62 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
CntrobQ8CB62 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
CntrobQ8CB62 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
CntrobQ8CB62 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
CntrobQ8CB62 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
CntrobQ8CB62 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
CntrobQ8CB62 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
CntrobQ8CB62 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
CntrobQ8CB62 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
CntrobQ8CB62 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
CntrobQ8CB62 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
CntrobQ8CB62 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
CntrobQ8CB62 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
CntrobQ8CB62 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
CntrobQ8CB62 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
CntrobQ8CB62 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
CntrobQ8CB62 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
CntrobQ8CB62 Gm10646-201ENSMUST00000213227 3293 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
CntrobQ8CB62 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
CntrobQ8CB62 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
CntrobQ8CB62 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
CntrobQ8CB62 Gm6092-201ENSMUST00000121659 2029 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
CntrobQ8CB62 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
CntrobQ8CB62 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
CntrobQ8CB62 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
CntrobQ8CB62 Tnfrsf9-205ENSMUST00000116257 2115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
CntrobQ8CB62 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
CntrobQ8CB62 Pla2g4a-201ENSMUST00000070200 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
CntrobQ8CB62 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
CntrobQ8CB62 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
CntrobQ8CB62 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
CntrobQ8CB62 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
CntrobQ8CB62 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
CntrobQ8CB62 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
CntrobQ8CB62 Gm12296-201ENSMUST00000144922 3220 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
CntrobQ8CB62 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
CntrobQ8CB62 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
CntrobQ8CB62 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
CntrobQ8CB62 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
CntrobQ8CB62 Chrnb2-203ENSMUST00000200558 3482 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
CntrobQ8CB62 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
CntrobQ8CB62 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
CntrobQ8CB62 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
CntrobQ8CB62 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
CntrobQ8CB62 1700017B05Rik-202ENSMUST00000213199 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
CntrobQ8CB62 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
CntrobQ8CB62 Fgl2-201ENSMUST00000035799 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
CntrobQ8CB62 Akap12-202ENSMUST00000215696 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
CntrobQ8CB62 Armc9-201ENSMUST00000027434 5127 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
CntrobQ8CB62 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms