Protein–RNA interactions for Protein: Q8C006

Trim35, Tripartite motif-containing protein 35, mousemouse

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Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim35Q8C006 Gm45345-201ENSMUST00000211427 555 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 AC167364.2-201ENSMUST00000221226 1037 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 AC154759.1-201ENSMUST00000224137 1159 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 AC114008.1-201ENSMUST00000226193 937 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Olfr798-201ENSMUST00000079810 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Mup3-201ENSMUST00000084531 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Gm10800-201ENSMUST00000099683 660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 AC124746.1-201ENSMUST00000227535 1300 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Gm6482-201ENSMUST00000168128 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Gm28278-201ENSMUST00000185603 1499 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 EU599041-203ENSMUST00000205748 1492 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 2310016D03Rik-201ENSMUST00000190206 1547 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Gm15328-204ENSMUST00000210330 1518 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Ighv1-24-201ENSMUST00000103509 294 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Ppih-205ENSMUST00000106321 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
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Trim35Q8C006 1700065J11Rik-201ENSMUST00000201560 424 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Trim35Q8C006 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Trim35Q8C006 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 AC187103.1-201ENSMUST00000224641 1475 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Acsl6-208ENSMUST00000108899 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Gm3476-202ENSMUST00000167913 1759 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Npm1-203ENSMUST00000101375 966 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Gm13600-201ENSMUST00000117949 744 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Gm15739-201ENSMUST00000118049 872 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Gm23022-201ENSMUST00000158768 180 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Olfr721-ps1-201ENSMUST00000165291 975 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
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