Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Gm13326-201ENSMUST00000118730 1011 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Dhx40-201ENSMUST00000018569 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Tmem184a-202ENSMUST00000110832 4326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Gm15983-201ENSMUST00000140000 4814 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Cabin1-201ENSMUST00000001712 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Zer1-201ENSMUST00000044751 4100 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Uhrf1-202ENSMUST00000113035 3402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Unkl-201ENSMUST00000015271 3414 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Pomgnt1-204ENSMUST00000120083 2953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Mical2-202ENSMUST00000050149 6669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Trim25-201ENSMUST00000000284 5566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Arhgef9-201ENSMUST00000113873 2117 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Rapgef4os2-201ENSMUST00000128165 2116 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Otog-201ENSMUST00000164538 10043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Ccdc136-208ENSMUST00000180829 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Fan1-201ENSMUST00000163289 3460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Sema4g-201ENSMUST00000026225 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Prkd2-202ENSMUST00000168093 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Diablo-207ENSMUST00000145152 2588 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Odf2l-202ENSMUST00000098538 2564 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Bace2-201ENSMUST00000047275 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Mkks-202ENSMUST00000110089 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Styx-205ENSMUST00000226873 12974 ntAPPRIS P1 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Col4a3-201ENSMUST00000113457 8554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Arpc3-202ENSMUST00000102525 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Cfb-207ENSMUST00000176203 2733 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Hyou1-206ENSMUST00000161318 4489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Zfp710-203ENSMUST00000166250 3606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Olfr464-205ENSMUST00000217112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Nfe2l1-212ENSMUST00000169828 3530 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Slc17a5-201ENSMUST00000052441 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 C4b-201ENSMUST00000069507 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Stk38-201ENSMUST00000009138 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Ints10-201ENSMUST00000034328 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Slc13a5-202ENSMUST00000137701 1746 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Tiam1-204ENSMUST00000114124 7406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Piwil1-202ENSMUST00000195959 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Dkk2-201ENSMUST00000029665 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Myh4-201ENSMUST00000018632 6016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Ntrk3-206ENSMUST00000195262 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Ints6l-201ENSMUST00000039374 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Adam8-202ENSMUST00000106069 3117 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Adam8-201ENSMUST00000026546 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Fdft1-201ENSMUST00000054963 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Gm42602-201ENSMUST00000200288 3224 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Syt15-201ENSMUST00000035351 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Ctc1-202ENSMUST00000116359 3978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Prdm1-202ENSMUST00000105490 4025 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.8 ms