Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR8

D13Ertd608e, D13Ertd608e protein, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D13Ertd608eQ3UPR8 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
D13Ertd608eQ3UPR8 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
D13Ertd608eQ3UPR8 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
D13Ertd608eQ3UPR8 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
D13Ertd608eQ3UPR8 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
D13Ertd608eQ3UPR8 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
D13Ertd608eQ3UPR8 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
D13Ertd608eQ3UPR8 Angptl2-201ENSMUST00000004208 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
D13Ertd608eQ3UPR8 5330417C22Rik-202ENSMUST00000106625 5836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm5441-201ENSMUST00000186454 5181 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
D13Ertd608eQ3UPR8 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
D13Ertd608eQ3UPR8 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
D13Ertd608eQ3UPR8 Srrm4-201ENSMUST00000076124 7472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
D13Ertd608eQ3UPR8 Tmcc2-201ENSMUST00000045473 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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D13Ertd608eQ3UPR8 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
D13Ertd608eQ3UPR8 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
D13Ertd608eQ3UPR8 Ldb2-204ENSMUST00000199256 2596 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
D13Ertd608eQ3UPR8 Chd7-206ENSMUST00000170391 3462 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
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D13Ertd608eQ3UPR8 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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D13Ertd608eQ3UPR8 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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D13Ertd608eQ3UPR8 Arhgef7-203ENSMUST00000098938 4628 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
D13Ertd608eQ3UPR8 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
D13Ertd608eQ3UPR8 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
D13Ertd608eQ3UPR8 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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D13Ertd608eQ3UPR8 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
D13Ertd608eQ3UPR8 Dhdds-201ENSMUST00000012262 3133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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D13Ertd608eQ3UPR8 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
D13Ertd608eQ3UPR8 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
D13Ertd608eQ3UPR8 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
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D13Ertd608eQ3UPR8 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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D13Ertd608eQ3UPR8 Tsc22d4-202ENSMUST00000100539 3983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
D13Ertd608eQ3UPR8 4732491K20Rik-201ENSMUST00000181774 3142 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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D13Ertd608eQ3UPR8 Cep250-201ENSMUST00000039994 7979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
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D13Ertd608eQ3UPR8 Prom2-202ENSMUST00000103214 4190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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D13Ertd608eQ3UPR8 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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D13Ertd608eQ3UPR8 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
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D13Ertd608eQ3UPR8 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
D13Ertd608eQ3UPR8 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
D13Ertd608eQ3UPR8 Cpt1c-201ENSMUST00000063761 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
D13Ertd608eQ3UPR8 Syncrip-208ENSMUST00000174282 3404 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
D13Ertd608eQ3UPR8 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
D13Ertd608eQ3UPR8 Ncdn-201ENSMUST00000030637 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm10646-201ENSMUST00000213227 3293 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
D13Ertd608eQ3UPR8 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
D13Ertd608eQ3UPR8 Ankrd31-203ENSMUST00000208758 5859 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
D13Ertd608eQ3UPR8 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
D13Ertd608eQ3UPR8 Myo9a-203ENSMUST00000128341 11985 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
D13Ertd608eQ3UPR8 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
D13Ertd608eQ3UPR8 Sirpa-201ENSMUST00000049262 3644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
D13Ertd608eQ3UPR8 Magee2-201ENSMUST00000033575 2316 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
D13Ertd608eQ3UPR8 Arid2-201ENSMUST00000096250 8507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
D13Ertd608eQ3UPR8 Gtf2i-219ENSMUST00000174155 4141 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
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D13Ertd608eQ3UPR8 Pcdhgb8-201ENSMUST00000195764 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
D13Ertd608eQ3UPR8 Gtf2i-216ENSMUST00000173888 2820 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
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