Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Skap2Q3UND0 Lsamp-201ENSMUST00000078873 2951 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Skap2Q3UND0 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Skap2Q3UND0 Zfp280b-201ENSMUST00000061617 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Skap2Q3UND0 Nfx1-203ENSMUST00000098143 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Skap2Q3UND0 Caprin1-202ENSMUST00000111147 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Skap2Q3UND0 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Skap2Q3UND0 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Skap2Q3UND0 Ets2-201ENSMUST00000023612 3890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Skap2Q3UND0 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Skap2Q3UND0 Atg14-202ENSMUST00000226299 3729 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Skap2Q3UND0 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Skap2Q3UND0 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Skap2Q3UND0 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Skap2Q3UND0 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Skap2Q3UND0 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Skap2Q3UND0 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Skap2Q3UND0 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Skap2Q3UND0 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Skap2Q3UND0 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Skap2Q3UND0 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Skap2Q3UND0 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Skap2Q3UND0 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Skap2Q3UND0 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Skap2Q3UND0 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Skap2Q3UND0 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Skap2Q3UND0 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Skap2Q3UND0 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Skap2Q3UND0 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Skap2Q3UND0 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Skap2Q3UND0 Ipo4-201ENSMUST00000047131 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Skap2Q3UND0 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Skap2Q3UND0 Ldb2-204ENSMUST00000199256 2596 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Skap2Q3UND0 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Skap2Q3UND0 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Skap2Q3UND0 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Skap2Q3UND0 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Skap2Q3UND0 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Skap2Q3UND0 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Skap2Q3UND0 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Skap2Q3UND0 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Skap2Q3UND0 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Skap2Q3UND0 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Skap2Q3UND0 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Skap2Q3UND0 Cpt1c-201ENSMUST00000063761 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Skap2Q3UND0 Gm28042-203ENSMUST00000156805 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Skap2Q3UND0 Dscaml1-201ENSMUST00000034592 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Skap2Q3UND0 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Skap2Q3UND0 Nxpe5-204ENSMUST00000161047 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Skap2Q3UND0 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Skap2Q3UND0 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Skap2Q3UND0 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Skap2Q3UND0 Gm43275-201ENSMUST00000202053 1020 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Skap2Q3UND0 Gm18515-201ENSMUST00000219755 797 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Skap2Q3UND0 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Skap2Q3UND0 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Skap2Q3UND0 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Skap2Q3UND0 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Skap2Q3UND0 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Skap2Q3UND0 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Skap2Q3UND0 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Skap2Q3UND0 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Skap2Q3UND0 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Skap2Q3UND0 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Skap2Q3UND0 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Skap2Q3UND0 Tacc2-205ENSMUST00000207282 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Skap2Q3UND0 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Skap2Q3UND0 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Skap2Q3UND0 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Skap2Q3UND0 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Skap2Q3UND0 AC107453.4-201ENSMUST00000227068 1817 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Skap2Q3UND0 Ing1-204ENSMUST00000210041 1881 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Skap2Q3UND0 Zfp354a-204ENSMUST00000109122 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Skap2Q3UND0 Gnl2-201ENSMUST00000030684 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Skap2Q3UND0 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Skap2Q3UND0 Fdft1-201ENSMUST00000054963 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Skap2Q3UND0 Chd7-206ENSMUST00000170391 3462 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Skap2Q3UND0 Camk2g-201ENSMUST00000071816 3703 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Skap2Q3UND0 Pnpla6-201ENSMUST00000004681 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Skap2Q3UND0 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Skap2Q3UND0 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Skap2Q3UND0 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Skap2Q3UND0 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Skap2Q3UND0 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Skap2Q3UND0 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Skap2Q3UND0 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Skap2Q3UND0 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Skap2Q3UND0 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Skap2Q3UND0 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Skap2Q3UND0 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Skap2Q3UND0 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Skap2Q3UND0 G530012D18Rik-201ENSMUST00000178024 420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Skap2Q3UND0 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Skap2Q3UND0 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Skap2Q3UND0 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Skap2Q3UND0 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Skap2Q3UND0 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Skap2Q3UND0 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Skap2Q3UND0 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Skap2Q3UND0 CT009764.1-201ENSMUST00000222260 483 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms