Protein–RNA interactions for Protein: Q03358

Msx2, Homeobox protein MSX-2, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx2Q03358 Dcst2-201ENSMUST00000208216 2285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Msx2Q03358 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Msx2Q03358 Vars2-201ENSMUST00000043674 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Msx2Q03358 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Msx2Q03358 Alox12-201ENSMUST00000000329 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Msx2Q03358 Ugt1a7c-201ENSMUST00000058237 3231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Msx2Q03358 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Msx2Q03358 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Msx2Q03358 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Msx2Q03358 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Msx2Q03358 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Msx2Q03358 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Msx2Q03358 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Msx2Q03358 Syn2-203ENSMUST00000203450 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Msx2Q03358 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Msx2Q03358 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Msx2Q03358 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Msx2Q03358 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Msx2Q03358 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Msx2Q03358 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Msx2Q03358 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Msx2Q03358 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Msx2Q03358 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Msx2Q03358 Colq-201ENSMUST00000112027 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Msx2Q03358 Tesk2-201ENSMUST00000045542 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Msx2Q03358 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Msx2Q03358 Atp1a3-205ENSMUST00000196684 3642 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Msx2Q03358 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Msx2Q03358 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Msx2Q03358 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Msx2Q03358 Ncdn-201ENSMUST00000030637 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Msx2Q03358 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Msx2Q03358 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Msx2Q03358 Ttll5-202ENSMUST00000040273 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Msx2Q03358 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Msx2Q03358 4933407I05Rik-204ENSMUST00000217562 1561 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Msx2Q03358 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Msx2Q03358 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Msx2Q03358 Rbm8a-203ENSMUST00000198027 2757 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Msx2Q03358 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Msx2Q03358 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Msx2Q03358 Ahnak2-201ENSMUST00000101010 2821 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Msx2Q03358 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Msx2Q03358 Gm20755-201ENSMUST00000196893 1827 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Msx2Q03358 Scaf1-201ENSMUST00000085383 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Msx2Q03358 Col20a1-202ENSMUST00000149179 3867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Msx2Q03358 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Msx2Q03358 Map3k12-208ENSMUST00000171565 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Msx2Q03358 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Msx2Q03358 Ccdc24-206ENSMUST00000164853 3990 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Msx2Q03358 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Msx2Q03358 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Msx2Q03358 Htr1f-201ENSMUST00000063076 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Msx2Q03358 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Msx2Q03358 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Msx2Q03358 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Msx2Q03358 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Msx2Q03358 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Msx2Q03358 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Msx2Q03358 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Msx2Q03358 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Msx2Q03358 4930412F09Rik-201ENSMUST00000139006 1017 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Msx2Q03358 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Msx2Q03358 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Msx2Q03358 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Msx2Q03358 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Msx2Q03358 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Msx2Q03358 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Msx2Q03358 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Msx2Q03358 AC153961.1-201ENSMUST00000217760 385 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Msx2Q03358 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Msx2Q03358 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Msx2Q03358 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Msx2Q03358 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Msx2Q03358 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Msx2Q03358 Sirpa-201ENSMUST00000049262 3644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Msx2Q03358 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Msx2Q03358 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Msx2Q03358 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Msx2Q03358 Slc38a5-202ENSMUST00000115590 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Msx2Q03358 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Msx2Q03358 Ppat-202ENSMUST00000140076 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Msx2Q03358 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Msx2Q03358 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Msx2Q03358 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Msx2Q03358 Foxd2os-201ENSMUST00000123272 2908 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Msx2Q03358 Mov10l1-203ENSMUST00000146993 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Msx2Q03358 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Msx2Q03358 Suclg2-201ENSMUST00000079847 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Msx2Q03358 Gm15958-202ENSMUST00000153479 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Msx2Q03358 Camk2g-201ENSMUST00000071816 3703 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Msx2Q03358 Gm35850-202ENSMUST00000211705 2120 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
Msx2Q03358 Inf2-201ENSMUST00000101029 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Msx2Q03358 Exoc4-203ENSMUST00000115080 2369 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Msx2Q03358 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Msx2Q03358 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Msx2Q03358 Limd1-201ENSMUST00000026269 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Msx2Q03358 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Msx2Q03358 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Msx2Q03358 Pck2-207ENSMUST00000226519 4625 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100.7 ms