Protein–RNA interactions for Protein: P50608

Fmod, Fibromodulin, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FmodP50608 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
FmodP50608 Mknk2-201ENSMUST00000003433 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
FmodP50608 Derl2-206ENSMUST00000143850 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
FmodP50608 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
FmodP50608 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
FmodP50608 Adra2b-202ENSMUST00000104934 4014 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
FmodP50608 1110051M20Rik-201ENSMUST00000064652 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
FmodP50608 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
FmodP50608 Thbs2-201ENSMUST00000170872 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
FmodP50608 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
FmodP50608 Tgoln1-201ENSMUST00000070524 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
FmodP50608 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
FmodP50608 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
FmodP50608 Slc2a10-201ENSMUST00000029196 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
FmodP50608 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
FmodP50608 Zfp30-202ENSMUST00000122387 3342 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
FmodP50608 Gm21986-201ENSMUST00000113671 5560 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
FmodP50608 Gm5124-202ENSMUST00000132683 2083 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
FmodP50608 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
FmodP50608 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
FmodP50608 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC9.47□□□□□ -0.89
FmodP50608 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
FmodP50608 Gm15567-201ENSMUST00000148699 2130 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
FmodP50608 4732491K20Rik-201ENSMUST00000181774 3142 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
FmodP50608 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
FmodP50608 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
FmodP50608 Flad1-202ENSMUST00000107426 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
FmodP50608 Trpv6-201ENSMUST00000031902 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
FmodP50608 Nectin4-201ENSMUST00000006578 3636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
FmodP50608 Itgb2-201ENSMUST00000000299 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
FmodP50608 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
FmodP50608 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC9.47□□□□□ -0.89
FmodP50608 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
FmodP50608 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
FmodP50608 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
FmodP50608 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
FmodP50608 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
FmodP50608 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
FmodP50608 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
FmodP50608 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
FmodP50608 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
FmodP50608 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
FmodP50608 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
FmodP50608 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
FmodP50608 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
FmodP50608 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
FmodP50608 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
FmodP50608 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
FmodP50608 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
FmodP50608 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
FmodP50608 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
FmodP50608 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
FmodP50608 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
FmodP50608 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
FmodP50608 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC9.47□□□□□ -0.89
FmodP50608 Araf-201ENSMUST00000001155 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
FmodP50608 Dclk2-202ENSMUST00000191752 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
FmodP50608 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
FmodP50608 Pdha1-201ENSMUST00000033662 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
FmodP50608 Htr1b-202ENSMUST00000183482 4724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
FmodP50608 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
FmodP50608 Armc1-201ENSMUST00000029125 3673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
FmodP50608 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
FmodP50608 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
FmodP50608 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
FmodP50608 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
FmodP50608 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
FmodP50608 Scn8a-203ENSMUST00000108908 7030 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
FmodP50608 Cox15-201ENSMUST00000045562 4798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
FmodP50608 Thsd4-206ENSMUST00000171654 8522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
FmodP50608 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
FmodP50608 Sptan1-204ENSMUST00000113717 7958 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
FmodP50608 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
FmodP50608 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
FmodP50608 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
FmodP50608 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
FmodP50608 Vrtn-203ENSMUST00000167227 3440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.46□□□□□ -0.89
FmodP50608 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
FmodP50608 Rnf41-201ENSMUST00000096386 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
FmodP50608 Ntrk3-205ENSMUST00000193002 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
FmodP50608 Vezt-202ENSMUST00000118077 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
FmodP50608 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
FmodP50608 Apol7a-203ENSMUST00000175919 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
FmodP50608 CT010480.4-201ENSMUST00000224654 2283 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
FmodP50608 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
FmodP50608 Nfx1-201ENSMUST00000030133 4349 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
FmodP50608 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
FmodP50608 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC9.46□□□□□ -0.9
FmodP50608 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
FmodP50608 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
FmodP50608 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC9.46□□□□□ -0.9
FmodP50608 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
FmodP50608 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
FmodP50608 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC9.46□□□□□ -0.9
FmodP50608 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC9.46□□□□□ -0.9
FmodP50608 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
FmodP50608 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC9.46□□□□□ -0.9
FmodP50608 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.9
FmodP50608 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
FmodP50608 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.1 ms