Protein–RNA interactions for Protein: O08795

Prkcsh, Glucosidase 2 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcshO08795 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
PrkcshO08795 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PrkcshO08795 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
PrkcshO08795 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PrkcshO08795 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PrkcshO08795 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PrkcshO08795 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PrkcshO08795 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PrkcshO08795 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PrkcshO08795 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PrkcshO08795 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PrkcshO08795 Thbs2-201ENSMUST00000170872 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PrkcshO08795 Gm10302-201ENSMUST00000174433 3535 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
PrkcshO08795 Kalrn-202ENSMUST00000089655 6506 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PrkcshO08795 Edar-201ENSMUST00000003312 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PrkcshO08795 1300002E11Rik-201ENSMUST00000180830 3557 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PrkcshO08795 Ift88-201ENSMUST00000122063 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PrkcshO08795 AC153524.2-202ENSMUST00000220401 1794 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
PrkcshO08795 AC113125.1-201ENSMUST00000226852 1774 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
PrkcshO08795 Mmrn2-201ENSMUST00000111908 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PrkcshO08795 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PrkcshO08795 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PrkcshO08795 Top1-201ENSMUST00000109468 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PrkcshO08795 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PrkcshO08795 Cdh18-203ENSMUST00000164787 2744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PrkcshO08795 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PrkcshO08795 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PrkcshO08795 C4b-201ENSMUST00000069507 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PrkcshO08795 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
PrkcshO08795 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
PrkcshO08795 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PrkcshO08795 Plcg2-201ENSMUST00000081232 4298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PrkcshO08795 Wnk4-201ENSMUST00000103108 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PrkcshO08795 Prox1-203ENSMUST00000177288 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PrkcshO08795 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PrkcshO08795 Col6a3-201ENSMUST00000056925 10106 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PrkcshO08795 Mro-206ENSMUST00000179472 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PrkcshO08795 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
PrkcshO08795 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PrkcshO08795 Gm12907-201ENSMUST00000148027 507 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PrkcshO08795 Gm17058-201ENSMUST00000168951 928 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PrkcshO08795 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PrkcshO08795 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PrkcshO08795 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
PrkcshO08795 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PrkcshO08795 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
PrkcshO08795 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PrkcshO08795 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PrkcshO08795 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PrkcshO08795 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PrkcshO08795 Zfp7-201ENSMUST00000023179 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PrkcshO08795 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PrkcshO08795 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PrkcshO08795 Cd247-205ENSMUST00000161559 1816 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PrkcshO08795 Zfp820-201ENSMUST00000084141 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PrkcshO08795 Chrm1-201ENSMUST00000035444 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PrkcshO08795 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PrkcshO08795 Ccdc14-201ENSMUST00000023532 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PrkcshO08795 Zfp609-201ENSMUST00000159109 7777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PrkcshO08795 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PrkcshO08795 Ank1-204ENSMUST00000117270 5652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PrkcshO08795 Zmynd8-205ENSMUST00000109266 5072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PrkcshO08795 Zmynd8-221ENSMUST00000177633 5093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PrkcshO08795 Gm35808-201ENSMUST00000204769 2602 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
PrkcshO08795 Sgo2b-201ENSMUST00000179944 3739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PrkcshO08795 Prpf31-206ENSMUST00000179769 3125 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PrkcshO08795 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PrkcshO08795 Olfr56-206ENSMUST00000203810 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PrkcshO08795 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PrkcshO08795 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PrkcshO08795 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PrkcshO08795 Gm16478-201ENSMUST00000208113 5084 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
PrkcshO08795 Lonp2-203ENSMUST00000122188 2372 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PrkcshO08795 A1bg-201ENSMUST00000096418 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PrkcshO08795 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
PrkcshO08795 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PrkcshO08795 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PrkcshO08795 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PrkcshO08795 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PrkcshO08795 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PrkcshO08795 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PrkcshO08795 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PrkcshO08795 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PrkcshO08795 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PrkcshO08795 Rpgr-205ENSMUST00000115533 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PrkcshO08795 Fgd4-204ENSMUST00000161188 2214 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PrkcshO08795 Nrxn3-203ENSMUST00000110133 2699 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PrkcshO08795 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PrkcshO08795 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PrkcshO08795 5430434F05Rik-201ENSMUST00000206080 3553 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
PrkcshO08795 Ccdc171-201ENSMUST00000053414 4525 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PrkcshO08795 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PrkcshO08795 Nup50-201ENSMUST00000165443 4741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PrkcshO08795 Trim42-201ENSMUST00000035026 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PrkcshO08795 Ncaph2-203ENSMUST00000088717 3302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PrkcshO08795 Gm35572-201ENSMUST00000212427 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PrkcshO08795 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PrkcshO08795 Ifit1bl1-202ENSMUST00000168254 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PrkcshO08795 Stoml3-201ENSMUST00000029307 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PrkcshO08795 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms