Protein–RNA interactions for Protein: F6Z9R1

Gm20538, Predicted gene 20538 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20538F6Z9R1 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Gm20538F6Z9R1 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Gm20538F6Z9R1 Senp6-203ENSMUST00000165607 3495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Gm20538F6Z9R1 Bloc1s6-201ENSMUST00000005954 3484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Gm20538F6Z9R1 1810034E14Rik-201ENSMUST00000181403 1805 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Gm20538F6Z9R1 Gm37474-201ENSMUST00000194812 1814 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Gm20538F6Z9R1 Inpp4b-212ENSMUST00000215332 5486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Gm20538F6Z9R1 Gm10687-201ENSMUST00000180670 3233 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Gm20538F6Z9R1 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Gm20538F6Z9R1 Scn3b-202ENSMUST00000114956 4045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Gm20538F6Z9R1 Egf-202ENSMUST00000197079 3346 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Gm20538F6Z9R1 Il13ra2-201ENSMUST00000033646 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Gm20538F6Z9R1 Gria3-201ENSMUST00000076349 5192 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Gm20538F6Z9R1 Tcf4-202ENSMUST00000078486 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Gm20538F6Z9R1 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Gm20538F6Z9R1 Camk2g-202ENSMUST00000080440 3604 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Gm20538F6Z9R1 Gm5281-201ENSMUST00000197542 2134 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Gm20538F6Z9R1 Il6st-210ENSMUST00000184949 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Gm20538F6Z9R1 Gm38300-201ENSMUST00000194245 1870 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Gm20538F6Z9R1 Pcx-204ENSMUST00000224726 4034 ntAPPRIS P3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Gm20538F6Z9R1 Grik1-211ENSMUST00000228188 3221 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Gm20538F6Z9R1 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Gm20538F6Z9R1 Vps8-203ENSMUST00000115397 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Gm20538F6Z9R1 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Gm20538F6Z9R1 Krba1-204ENSMUST00000114572 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Gm20538F6Z9R1 Arhgap45-203ENSMUST00000105373 3867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Gm20538F6Z9R1 Stat4-201ENSMUST00000027277 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Gm20538F6Z9R1 Gm37036-201ENSMUST00000192836 2506 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Gm20538F6Z9R1 Hnrnpc-210ENSMUST00000228232 2535 ntAPPRIS P5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Gm20538F6Z9R1 Rprd2-201ENSMUST00000090791 7756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Gm20538F6Z9R1 Epb41l3-215ENSMUST00000225977 3188 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Gm20538F6Z9R1 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Gm20538F6Z9R1 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Gm20538F6Z9R1 Xpo5-201ENSMUST00000087031 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Gm20538F6Z9R1 Crebbp-205ENSMUST00000205765 7749 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Gm20538F6Z9R1 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Gm20538F6Z9R1 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Gm20538F6Z9R1 Il12a-202ENSMUST00000107816 1268 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Gm20538F6Z9R1 Rhox10-201ENSMUST00000115150 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Gm20538F6Z9R1 Gm15809-201ENSMUST00000159361 661 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Gm20538F6Z9R1 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Gm20538F6Z9R1 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Gm20538F6Z9R1 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Gm20538F6Z9R1 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Gm20538F6Z9R1 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Gm20538F6Z9R1 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Gm20538F6Z9R1 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Gm20538F6Z9R1 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Gm20538F6Z9R1 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Gm20538F6Z9R1 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Gm20538F6Z9R1 Gm5619-201ENSMUST00000071172 760 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Gm20538F6Z9R1 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Gm20538F6Z9R1 A330033J07Rik-201ENSMUST00000180921 2816 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Gm20538F6Z9R1 Gm37459-201ENSMUST00000192259 2840 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Gm20538F6Z9R1 AC122346.2-201ENSMUST00000224326 2931 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Gm20538F6Z9R1 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Gm20538F6Z9R1 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Gm20538F6Z9R1 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Gm20538F6Z9R1 Gm2a-201ENSMUST00000000608 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Gm20538F6Z9R1 Gm20043-201ENSMUST00000222267 2565 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Gm20538F6Z9R1 Syna-201ENSMUST00000149604 2026 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Gm20538F6Z9R1 Pcdhb8-201ENSMUST00000051163 3334 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Gm20538F6Z9R1 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Gm20538F6Z9R1 Tra2b-204ENSMUST00000161286 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Gm20538F6Z9R1 Clasp1-210ENSMUST00000188710 10265 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Gm20538F6Z9R1 Chrm5-201ENSMUST00000099589 1599 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Gm20538F6Z9R1 Gcc2-207ENSMUST00000162041 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Gm20538F6Z9R1 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Gm20538F6Z9R1 Spn-201ENSMUST00000049931 3743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Gm20538F6Z9R1 Atcayos-203ENSMUST00000150782 3057 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Gm20538F6Z9R1 Gm15708-201ENSMUST00000156467 1765 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Gm20538F6Z9R1 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Gm20538F6Z9R1 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Gm20538F6Z9R1 Tex24-201ENSMUST00000095375 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Gm20538F6Z9R1 Nlrp3-201ENSMUST00000079476 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Gm20538F6Z9R1 Gm30074-201ENSMUST00000193192 2541 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Gm20538F6Z9R1 Kdm3a-202ENSMUST00000167220 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Gm20538F6Z9R1 Nbas-201ENSMUST00000042953 7234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Gm20538F6Z9R1 Scmh1-203ENSMUST00000106298 1995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Gm20538F6Z9R1 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Gm20538F6Z9R1 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Gm20538F6Z9R1 Ap2b1-205ENSMUST00000176430 3596 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Gm20538F6Z9R1 Pcdhb3-201ENSMUST00000051754 3787 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Gm20538F6Z9R1 Dusp18-201ENSMUST00000055931 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Gm20538F6Z9R1 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Gm20538F6Z9R1 Creb5-212ENSMUST00000205120 7482 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Gm20538F6Z9R1 Zbtb38-201ENSMUST00000093798 4091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Gm20538F6Z9R1 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Gm20538F6Z9R1 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Gm20538F6Z9R1 Pex5l-208ENSMUST00000192093 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Gm20538F6Z9R1 Nck1-201ENSMUST00000112874 1513 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Gm20538F6Z9R1 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Gm20538F6Z9R1 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Gm20538F6Z9R1 Slc25a53-214ENSMUST00000171738 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Gm20538F6Z9R1 Gm37121-201ENSMUST00000192219 2556 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Gm20538F6Z9R1 Cse1l-201ENSMUST00000002790 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Gm20538F6Z9R1 Kif1b-201ENSMUST00000030806 6991 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Gm20538F6Z9R1 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Gm20538F6Z9R1 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Gm20538F6Z9R1 Rbm19-201ENSMUST00000031590 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms