Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6J4

Vpreb3, Pre-B lymphocyte gene 3, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb3D3Z6J4 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Prdm1-202ENSMUST00000105490 4025 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Fam234b-201ENSMUST00000111915 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Adgrl3-215ENSMUST00000120673 5178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Itga10-202ENSMUST00000119365 5035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Enah-211ENSMUST00000193703 11229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC7.34□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Pip5k1a-205ENSMUST00000107233 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Syn2-202ENSMUST00000169345 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Umodl1-203ENSMUST00000114555 5041 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms