Protein–RNA interactions for Protein: D3Z235

Gm3543, Predicted gene 3543, mousemouse

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Length 184 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3543D3Z235 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm3543D3Z235 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm3543D3Z235 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm3543D3Z235 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm3543D3Z235 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm3543D3Z235 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm3543D3Z235 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm3543D3Z235 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm3543D3Z235 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm3543D3Z235 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm3543D3Z235 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm3543D3Z235 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm3543D3Z235 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm3543D3Z235 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm3543D3Z235 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm3543D3Z235 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm3543D3Z235 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm3543D3Z235 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm3543D3Z235 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm3543D3Z235 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm3543D3Z235 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm3543D3Z235 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm3543D3Z235 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm3543D3Z235 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm3543D3Z235 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm3543D3Z235 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm3543D3Z235 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm3543D3Z235 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm3543D3Z235 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm3543D3Z235 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm3543D3Z235 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm3543D3Z235 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm3543D3Z235 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm3543D3Z235 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm3543D3Z235 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm3543D3Z235 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm3543D3Z235 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm3543D3Z235 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm3543D3Z235 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm3543D3Z235 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm3543D3Z235 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm3543D3Z235 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm3543D3Z235 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm3543D3Z235 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm3543D3Z235 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm3543D3Z235 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm3543D3Z235 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm3543D3Z235 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm3543D3Z235 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm3543D3Z235 Ptpn11-201ENSMUST00000054547 5535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm3543D3Z235 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm3543D3Z235 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm3543D3Z235 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm3543D3Z235 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm3543D3Z235 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm3543D3Z235 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm3543D3Z235 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm3543D3Z235 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm3543D3Z235 CT009713.5-203ENSMUST00000224218 2079 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm3543D3Z235 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm3543D3Z235 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm3543D3Z235 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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Gm3543D3Z235 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm3543D3Z235 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm3543D3Z235 Mir124a-1hg-201ENSMUST00000180610 4103 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm3543D3Z235 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm3543D3Z235 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm3543D3Z235 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm3543D3Z235 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm3543D3Z235 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm3543D3Z235 AC131586.1-201ENSMUST00000228844 2964 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm3543D3Z235 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm3543D3Z235 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm3543D3Z235 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm3543D3Z235 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm3543D3Z235 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm3543D3Z235 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm3543D3Z235 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm3543D3Z235 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm3543D3Z235 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm3543D3Z235 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm3543D3Z235 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm3543D3Z235 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm3543D3Z235 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm3543D3Z235 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm3543D3Z235 Gm26846-201ENSMUST00000181865 4869 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm3543D3Z235 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm3543D3Z235 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm3543D3Z235 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm3543D3Z235 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm3543D3Z235 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
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