Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2P8

Vamp5, Vesicle-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp5Q9Z2P8 Htr1f-201ENSMUST00000063076 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Vamp5Q9Z2P8 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Vamp5Q9Z2P8 Fdft1-201ENSMUST00000054963 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Vamp5Q9Z2P8 Sgsm1-202ENSMUST00000057209 4339 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Vamp5Q9Z2P8 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Vamp5Q9Z2P8 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Vamp5Q9Z2P8 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Vamp5Q9Z2P8 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Vamp5Q9Z2P8 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Vamp5Q9Z2P8 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Vamp5Q9Z2P8 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Vamp5Q9Z2P8 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Vamp5Q9Z2P8 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Vamp5Q9Z2P8 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Vamp5Q9Z2P8 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Vamp5Q9Z2P8 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Vamp5Q9Z2P8 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Vamp5Q9Z2P8 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Vamp5Q9Z2P8 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Vamp5Q9Z2P8 AC115891.3-201ENSMUST00000219161 2472 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Vamp5Q9Z2P8 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Vamp5Q9Z2P8 Polq-202ENSMUST00000071452 7290 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Vamp5Q9Z2P8 Dmbx1-203ENSMUST00000124071 4017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Vamp5Q9Z2P8 Rtn3-204ENSMUST00000088171 4973 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Vamp5Q9Z2P8 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Vamp5Q9Z2P8 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Vamp5Q9Z2P8 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Vamp5Q9Z2P8 Il34-201ENSMUST00000076846 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Vamp5Q9Z2P8 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Vamp5Q9Z2P8 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Vamp5Q9Z2P8 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Vamp5Q9Z2P8 Cfap61-204ENSMUST00000126415 2256 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Vamp5Q9Z2P8 Dcst2-201ENSMUST00000208216 2285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Vamp5Q9Z2P8 Olfr243-202ENSMUST00000215723 4735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Vamp5Q9Z2P8 Myo9a-206ENSMUST00000136740 12252 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Vamp5Q9Z2P8 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Vamp5Q9Z2P8 Gm10912-201ENSMUST00000104891 1661 ntAPPRIS P1 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Vamp5Q9Z2P8 Unc5cl-201ENSMUST00000074574 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Vamp5Q9Z2P8 Il1rap-202ENSMUST00000096129 4438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Vamp5Q9Z2P8 Fos-201ENSMUST00000021674 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Vamp5Q9Z2P8 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Vamp5Q9Z2P8 Sept9-204ENSMUST00000106349 2932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Vamp5Q9Z2P8 Avil-203ENSMUST00000129173 2925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Vamp5Q9Z2P8 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
Vamp5Q9Z2P8 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Vamp5Q9Z2P8 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Vamp5Q9Z2P8 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Vamp5Q9Z2P8 Kcnab2-207ENSMUST00000160884 3922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Vamp5Q9Z2P8 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Vamp5Q9Z2P8 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Vamp5Q9Z2P8 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Vamp5Q9Z2P8 Atp2b2-202ENSMUST00000101044 4586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Vamp5Q9Z2P8 Enah-211ENSMUST00000193703 11229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Vamp5Q9Z2P8 A1cf-201ENSMUST00000075838 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Vamp5Q9Z2P8 Ankrd46-201ENSMUST00000057486 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Vamp5Q9Z2P8 Svil-204ENSMUST00000127297 6243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Vamp5Q9Z2P8 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Vamp5Q9Z2P8 Ctc1-202ENSMUST00000116359 3978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Vamp5Q9Z2P8 Chd1-201ENSMUST00000024620 3196 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Vamp5Q9Z2P8 Trpm2-203ENSMUST00000105401 7274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Vamp5Q9Z2P8 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
Vamp5Q9Z2P8 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
Vamp5Q9Z2P8 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
Vamp5Q9Z2P8 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Vamp5Q9Z2P8 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Vamp5Q9Z2P8 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Vamp5Q9Z2P8 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Vamp5Q9Z2P8 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Vamp5Q9Z2P8 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
Vamp5Q9Z2P8 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
Vamp5Q9Z2P8 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
Vamp5Q9Z2P8 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Vamp5Q9Z2P8 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Vamp5Q9Z2P8 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Vamp5Q9Z2P8 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Vamp5Q9Z2P8 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Vamp5Q9Z2P8 Sik2-206ENSMUST00000176824 5369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Vamp5Q9Z2P8 4833418N02Rik-201ENSMUST00000137539 1820 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Vamp5Q9Z2P8 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Vamp5Q9Z2P8 4930432K21Rik-202ENSMUST00000118856 2366 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Vamp5Q9Z2P8 Tceal8-204ENSMUST00000163584 2358 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Vamp5Q9Z2P8 Ccdc187-202ENSMUST00000217256 9411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Vamp5Q9Z2P8 Piwil1-202ENSMUST00000195959 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Vamp5Q9Z2P8 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Vamp5Q9Z2P8 Wars-205ENSMUST00000161410 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Vamp5Q9Z2P8 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Vamp5Q9Z2P8 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Vamp5Q9Z2P8 Rps6ka1-209ENSMUST00000174481 2228 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Vamp5Q9Z2P8 Unc45a-202ENSMUST00000107368 3635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Vamp5Q9Z2P8 Lhx9-202ENSMUST00000046870 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Vamp5Q9Z2P8 Gm11033-203ENSMUST00000156185 2321 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Vamp5Q9Z2P8 Gm20715-201ENSMUST00000054781 4460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Vamp5Q9Z2P8 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Vamp5Q9Z2P8 Krt75-201ENSMUST00000042957 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Vamp5Q9Z2P8 Tubgcp4-201ENSMUST00000039541 4206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Vamp5Q9Z2P8 Phf21a-202ENSMUST00000068702 6023 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Vamp5Q9Z2P8 Zfp804b-202ENSMUST00000200317 4430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Vamp5Q9Z2P8 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Vamp5Q9Z2P8 Lama3-201ENSMUST00000092070 10548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Vamp5Q9Z2P8 Heatr6-201ENSMUST00000001002 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.8 ms