Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S7

Cldn9, Claudin-9, mousemouse

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Length 217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn9Q9Z0S7 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn9Q9Z0S7 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn9Q9Z0S7 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn9Q9Z0S7 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn9Q9Z0S7 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn9Q9Z0S7 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn9Q9Z0S7 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn9Q9Z0S7 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn9Q9Z0S7 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn9Q9Z0S7 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn9Q9Z0S7 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn9Q9Z0S7 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn9Q9Z0S7 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn9Q9Z0S7 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn9Q9Z0S7 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn9Q9Z0S7 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn9Q9Z0S7 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn9Q9Z0S7 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn9Q9Z0S7 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn9Q9Z0S7 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn9Q9Z0S7 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn9Q9Z0S7 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn9Q9Z0S7 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn9Q9Z0S7 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn9Q9Z0S7 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn9Q9Z0S7 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn9Q9Z0S7 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn9Q9Z0S7 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn9Q9Z0S7 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn9Q9Z0S7 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn9Q9Z0S7 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn9Q9Z0S7 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn9Q9Z0S7 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn9Q9Z0S7 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn9Q9Z0S7 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn9Q9Z0S7 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn9Q9Z0S7 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn9Q9Z0S7 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn9Q9Z0S7 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn9Q9Z0S7 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn9Q9Z0S7 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn9Q9Z0S7 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn9Q9Z0S7 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn9Q9Z0S7 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn9Q9Z0S7 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn9Q9Z0S7 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn9Q9Z0S7 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn9Q9Z0S7 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn9Q9Z0S7 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn9Q9Z0S7 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn9Q9Z0S7 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn9Q9Z0S7 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
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Cldn9Q9Z0S7 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
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Cldn9Q9Z0S7 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn9Q9Z0S7 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn9Q9Z0S7 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn9Q9Z0S7 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn9Q9Z0S7 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn9Q9Z0S7 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn9Q9Z0S7 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
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Cldn9Q9Z0S7 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
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Cldn9Q9Z0S7 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn9Q9Z0S7 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
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Cldn9Q9Z0S7 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn9Q9Z0S7 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn9Q9Z0S7 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn9Q9Z0S7 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
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Cldn9Q9Z0S7 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn9Q9Z0S7 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn9Q9Z0S7 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn9Q9Z0S7 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn9Q9Z0S7 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn9Q9Z0S7 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn9Q9Z0S7 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn9Q9Z0S7 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn9Q9Z0S7 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn9Q9Z0S7 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn9Q9Z0S7 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn9Q9Z0S7 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn9Q9Z0S7 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn9Q9Z0S7 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn9Q9Z0S7 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn9Q9Z0S7 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn9Q9Z0S7 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn9Q9Z0S7 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn9Q9Z0S7 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn9Q9Z0S7 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn9Q9Z0S7 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn9Q9Z0S7 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn9Q9Z0S7 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn9Q9Z0S7 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn9Q9Z0S7 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn9Q9Z0S7 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
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