Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 Ing1-204ENSMUST00000210041 1881 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 Trak1-201ENSMUST00000045903 4827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 Pip5k1a-205ENSMUST00000107233 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 Scyl2-204ENSMUST00000174252 4817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 Atg14-202ENSMUST00000226299 3729 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 Zfp354a-204ENSMUST00000109122 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 Casc1-203ENSMUST00000111728 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 Zfp384-205ENSMUST00000112424 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 Ccdc129-201ENSMUST00000044729 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 H2-T24-201ENSMUST00000113760 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 Ncstn-201ENSMUST00000003550 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 Alox12-201ENSMUST00000000329 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 Asb6-201ENSMUST00000041726 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 Ccdc96-201ENSMUST00000060100 3585 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 Mettl14-204ENSMUST00000174323 4202 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 4732491K20Rik-201ENSMUST00000181774 3142 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 Il27ra-201ENSMUST00000005601 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 2700068H02Rik-201ENSMUST00000137882 1872 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 1110051M20Rik-201ENSMUST00000064652 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 AC131586.1-201ENSMUST00000228844 2964 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 Recql-202ENSMUST00000100832 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 Kcnh3-201ENSMUST00000041415 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 Ebf3-202ENSMUST00000106118 3736 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms