Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SIN3AQ96ST3 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SIN3AQ96ST3 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SIN3AQ96ST3 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SIN3AQ96ST3 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SIN3AQ96ST3 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SIN3AQ96ST3 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SIN3AQ96ST3 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SIN3AQ96ST3 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SIN3AQ96ST3 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SIN3AQ96ST3 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SIN3AQ96ST3 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SIN3AQ96ST3 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SIN3AQ96ST3 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SIN3AQ96ST3 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SIN3AQ96ST3 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SIN3AQ96ST3 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SIN3AQ96ST3 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SIN3AQ96ST3 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SIN3AQ96ST3 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SIN3AQ96ST3 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SIN3AQ96ST3 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SIN3AQ96ST3 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SIN3AQ96ST3 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SIN3AQ96ST3 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SIN3AQ96ST3 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SIN3AQ96ST3 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SIN3AQ96ST3 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SIN3AQ96ST3 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SIN3AQ96ST3 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SIN3AQ96ST3 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SIN3AQ96ST3 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SIN3AQ96ST3 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SIN3AQ96ST3 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SIN3AQ96ST3 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SIN3AQ96ST3 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SIN3AQ96ST3 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SIN3AQ96ST3 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SIN3AQ96ST3 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SIN3AQ96ST3 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SIN3AQ96ST3 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SIN3AQ96ST3 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SIN3AQ96ST3 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SIN3AQ96ST3 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SIN3AQ96ST3 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SIN3AQ96ST3 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SIN3AQ96ST3 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SIN3AQ96ST3 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SIN3AQ96ST3 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SIN3AQ96ST3 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SIN3AQ96ST3 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SIN3AQ96ST3 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SIN3AQ96ST3 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SIN3AQ96ST3 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SIN3AQ96ST3 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SIN3AQ96ST3 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SIN3AQ96ST3 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SIN3AQ96ST3 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SIN3AQ96ST3 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SIN3AQ96ST3 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SIN3AQ96ST3 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SIN3AQ96ST3 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SIN3AQ96ST3 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SIN3AQ96ST3 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SIN3AQ96ST3 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SIN3AQ96ST3 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SIN3AQ96ST3 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SIN3AQ96ST3 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SIN3AQ96ST3 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SIN3AQ96ST3 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC21.33■■□□□ 1
SIN3AQ96ST3 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SIN3AQ96ST3 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC21.33■■□□□ 1
SIN3AQ96ST3 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SIN3AQ96ST3 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SIN3AQ96ST3 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SIN3AQ96ST3 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SIN3AQ96ST3 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SIN3AQ96ST3 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SIN3AQ96ST3 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SIN3AQ96ST3 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SIN3AQ96ST3 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SIN3AQ96ST3 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SIN3AQ96ST3 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SIN3AQ96ST3 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SIN3AQ96ST3 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SIN3AQ96ST3 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SIN3AQ96ST3 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SIN3AQ96ST3 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SIN3AQ96ST3 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SIN3AQ96ST3 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SIN3AQ96ST3 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SIN3AQ96ST3 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SIN3AQ96ST3 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SIN3AQ96ST3 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SIN3AQ96ST3 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SIN3AQ96ST3 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SIN3AQ96ST3 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SIN3AQ96ST3 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
SIN3AQ96ST3 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SIN3AQ96ST3 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms