Protein–RNA interactions for Protein: Q920F6

Smc1b, Structural maintenance of chromosomes protein 1B, mousemouse

Predictions only

Length 1,248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smc1bQ920F6 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smc1bQ920F6 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smc1bQ920F6 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smc1bQ920F6 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smc1bQ920F6 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smc1bQ920F6 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smc1bQ920F6 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smc1bQ920F6 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smc1bQ920F6 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smc1bQ920F6 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Smc1bQ920F6 Scg5-201ENSMUST00000024005 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smc1bQ920F6 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smc1bQ920F6 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smc1bQ920F6 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smc1bQ920F6 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smc1bQ920F6 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smc1bQ920F6 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smc1bQ920F6 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smc1bQ920F6 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smc1bQ920F6 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smc1bQ920F6 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smc1bQ920F6 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smc1bQ920F6 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smc1bQ920F6 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Smc1bQ920F6 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smc1bQ920F6 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smc1bQ920F6 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smc1bQ920F6 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smc1bQ920F6 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smc1bQ920F6 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Smc1bQ920F6 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smc1bQ920F6 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smc1bQ920F6 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smc1bQ920F6 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smc1bQ920F6 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smc1bQ920F6 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smc1bQ920F6 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smc1bQ920F6 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smc1bQ920F6 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smc1bQ920F6 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smc1bQ920F6 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Smc1bQ920F6 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smc1bQ920F6 1700081H04Rik-201ENSMUST00000190550 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smc1bQ920F6 Gm37299-201ENSMUST00000193951 826 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Smc1bQ920F6 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Smc1bQ920F6 Gm44980-201ENSMUST00000205826 314 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Smc1bQ920F6 Gm45285-201ENSMUST00000210418 749 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smc1bQ920F6 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smc1bQ920F6 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smc1bQ920F6 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smc1bQ920F6 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smc1bQ920F6 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smc1bQ920F6 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smc1bQ920F6 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smc1bQ920F6 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smc1bQ920F6 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Smc1bQ920F6 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smc1bQ920F6 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smc1bQ920F6 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smc1bQ920F6 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smc1bQ920F6 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smc1bQ920F6 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smc1bQ920F6 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smc1bQ920F6 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smc1bQ920F6 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smc1bQ920F6 Gm3765-201ENSMUST00000130985 1447 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Smc1bQ920F6 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smc1bQ920F6 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smc1bQ920F6 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smc1bQ920F6 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smc1bQ920F6 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smc1bQ920F6 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smc1bQ920F6 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smc1bQ920F6 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smc1bQ920F6 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smc1bQ920F6 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smc1bQ920F6 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smc1bQ920F6 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smc1bQ920F6 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smc1bQ920F6 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smc1bQ920F6 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smc1bQ920F6 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smc1bQ920F6 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smc1bQ920F6 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smc1bQ920F6 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smc1bQ920F6 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smc1bQ920F6 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smc1bQ920F6 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smc1bQ920F6 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smc1bQ920F6 Mrps17-204ENSMUST00000119604 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smc1bQ920F6 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Smc1bQ920F6 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smc1bQ920F6 Churc1-203ENSMUST00000126408 462 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smc1bQ920F6 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smc1bQ920F6 Nop16-202ENSMUST00000148222 790 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smc1bQ920F6 Gm15523-201ENSMUST00000160463 439 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smc1bQ920F6 Gm6485-201ENSMUST00000160676 439 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Smc1bQ920F6 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smc1bQ920F6 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smc1bQ920F6 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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