Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 506 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ubxn4Q8VCH8 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ubxn4Q8VCH8 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ubxn4Q8VCH8 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ubxn4Q8VCH8 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ubxn4Q8VCH8 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ubxn4Q8VCH8 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Ubxn4Q8VCH8 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ubxn4Q8VCH8 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ubxn4Q8VCH8 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ubxn4Q8VCH8 Gm39317-201ENSMUST00000213360 1138 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ubxn4Q8VCH8 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ubxn4Q8VCH8 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ubxn4Q8VCH8 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Ubxn4Q8VCH8 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Ubxn4Q8VCH8 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Ubxn4Q8VCH8 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ubxn4Q8VCH8 Olfr311-201ENSMUST00000071625 927 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ubxn4Q8VCH8 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ubxn4Q8VCH8 Il6st-201ENSMUST00000070731 5207 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ubxn4Q8VCH8 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ubxn4Q8VCH8 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Ubxn4Q8VCH8 Jade1-201ENSMUST00000026865 5481 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ubxn4Q8VCH8 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ubxn4Q8VCH8 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ubxn4Q8VCH8 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ubxn4Q8VCH8 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ubxn4Q8VCH8 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ubxn4Q8VCH8 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ubxn4Q8VCH8 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ubxn4Q8VCH8 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ubxn4Q8VCH8 Myo1h-210ENSMUST00000202006 4631 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ubxn4Q8VCH8 Col20a1-201ENSMUST00000108856 4489 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ubxn4Q8VCH8 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ubxn4Q8VCH8 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ubxn4Q8VCH8 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ubxn4Q8VCH8 Gm13326-201ENSMUST00000118730 1011 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ubxn4Q8VCH8 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ubxn4Q8VCH8 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ubxn4Q8VCH8 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ubxn4Q8VCH8 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ubxn4Q8VCH8 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ubxn4Q8VCH8 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ubxn4Q8VCH8 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ubxn4Q8VCH8 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ubxn4Q8VCH8 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ubxn4Q8VCH8 Pias2-203ENSMUST00000168882 4984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ubxn4Q8VCH8 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ubxn4Q8VCH8 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ubxn4Q8VCH8 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ubxn4Q8VCH8 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ubxn4Q8VCH8 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ubxn4Q8VCH8 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ubxn4Q8VCH8 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ubxn4Q8VCH8 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ubxn4Q8VCH8 Dync1i2-201ENSMUST00000081710 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ubxn4Q8VCH8 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ubxn4Q8VCH8 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ubxn4Q8VCH8 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ubxn4Q8VCH8 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ubxn4Q8VCH8 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ubxn4Q8VCH8 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ubxn4Q8VCH8 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ubxn4Q8VCH8 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ubxn4Q8VCH8 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ubxn4Q8VCH8 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ubxn4Q8VCH8 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ubxn4Q8VCH8 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ubxn4Q8VCH8 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ubxn4Q8VCH8 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ubxn4Q8VCH8 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ubxn4Q8VCH8 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ubxn4Q8VCH8 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ubxn4Q8VCH8 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ubxn4Q8VCH8 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ubxn4Q8VCH8 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ubxn4Q8VCH8 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Ubxn4Q8VCH8 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ubxn4Q8VCH8 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ubxn4Q8VCH8 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ubxn4Q8VCH8 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ubxn4Q8VCH8 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ubxn4Q8VCH8 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ubxn4Q8VCH8 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ubxn4Q8VCH8 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Ubxn4Q8VCH8 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ubxn4Q8VCH8 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ubxn4Q8VCH8 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Ubxn4Q8VCH8 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ubxn4Q8VCH8 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ubxn4Q8VCH8 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ubxn4Q8VCH8 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ubxn4Q8VCH8 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ubxn4Q8VCH8 Eif3a-201ENSMUST00000025955 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ubxn4Q8VCH8 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ubxn4Q8VCH8 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ubxn4Q8VCH8 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ubxn4Q8VCH8 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ubxn4Q8VCH8 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ubxn4Q8VCH8 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
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