Protein–RNA interactions for Protein: Q8K377

Lrrtm1, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 522 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm1Q8K377 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Lrrtm1Q8K377 B3glct-201ENSMUST00000100404 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Lrrtm1Q8K377 Hpcal4-201ENSMUST00000059667 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Lrrtm1Q8K377 Pck2-201ENSMUST00000048781 3400 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Lrrtm1Q8K377 Gm40617-201ENSMUST00000218840 2420 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Lrrtm1Q8K377 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Lrrtm1Q8K377 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Lrrtm1Q8K377 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Lrrtm1Q8K377 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Lrrtm1Q8K377 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Lrrtm1Q8K377 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Lrrtm1Q8K377 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Lrrtm1Q8K377 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Lrrtm1Q8K377 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Lrrtm1Q8K377 4631405K08Rik-201ENSMUST00000180420 2112 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Lrrtm1Q8K377 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Lrrtm1Q8K377 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Lrrtm1Q8K377 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Lrrtm1Q8K377 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Lrrtm1Q8K377 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Lrrtm1Q8K377 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Lrrtm1Q8K377 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Lrrtm1Q8K377 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Lrrtm1Q8K377 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Lrrtm1Q8K377 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Lrrtm1Q8K377 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Lrrtm1Q8K377 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Lrrtm1Q8K377 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Lrrtm1Q8K377 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Lrrtm1Q8K377 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Lrrtm1Q8K377 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Lrrtm1Q8K377 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Lrrtm1Q8K377 Shc1-210ENSMUST00000191485 3154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Lrrtm1Q8K377 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Lrrtm1Q8K377 Synpr-201ENSMUST00000070323 2541 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Lrrtm1Q8K377 Pyurf-201ENSMUST00000053386 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Lrrtm1Q8K377 Megf11-203ENSMUST00000118485 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Lrrtm1Q8K377 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Lrrtm1Q8K377 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Lrrtm1Q8K377 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Lrrtm1Q8K377 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Lrrtm1Q8K377 Enpp4-201ENSMUST00000024757 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Lrrtm1Q8K377 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Lrrtm1Q8K377 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Lrrtm1Q8K377 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Lrrtm1Q8K377 Gm38901-201ENSMUST00000202448 3008 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Lrrtm1Q8K377 Olfr370-203ENSMUST00000214156 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Lrrtm1Q8K377 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Lrrtm1Q8K377 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Lrrtm1Q8K377 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Lrrtm1Q8K377 Flcn-203ENSMUST00000102697 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Lrrtm1Q8K377 Pkp4-201ENSMUST00000037903 4378 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Lrrtm1Q8K377 Mier1-204ENSMUST00000106857 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Lrrtm1Q8K377 Dph6-203ENSMUST00000102542 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Lrrtm1Q8K377 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Lrrtm1Q8K377 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Lrrtm1Q8K377 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Lrrtm1Q8K377 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Lrrtm1Q8K377 Psd-201ENSMUST00000041391 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Lrrtm1Q8K377 Psd-202ENSMUST00000096029 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Lrrtm1Q8K377 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Lrrtm1Q8K377 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
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Lrrtm1Q8K377 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Lrrtm1Q8K377 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
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Lrrtm1Q8K377 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Lrrtm1Q8K377 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Lrrtm1Q8K377 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
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Lrrtm1Q8K377 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Lrrtm1Q8K377 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Lrrtm1Q8K377 CT010480.4-201ENSMUST00000224654 2283 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Lrrtm1Q8K377 Mapre2-203ENSMUST00000118826 3052 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Lrrtm1Q8K377 Bace2-201ENSMUST00000047275 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Lrrtm1Q8K377 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Lrrtm1Q8K377 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Lrrtm1Q8K377 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Lrrtm1Q8K377 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Lrrtm1Q8K377 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Lrrtm1Q8K377 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Lrrtm1Q8K377 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Lrrtm1Q8K377 Camk1d-201ENSMUST00000044009 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Lrrtm1Q8K377 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Lrrtm1Q8K377 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Lrrtm1Q8K377 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Lrrtm1Q8K377 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Lrrtm1Q8K377 Ebf3-202ENSMUST00000106118 3736 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Lrrtm1Q8K377 Dzip1l-203ENSMUST00000112885 4350 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Lrrtm1Q8K377 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Lrrtm1Q8K377 Hectd4-201ENSMUST00000042614 15482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Lrrtm1Q8K377 Grin2b-202ENSMUST00000111905 7484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
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Lrrtm1Q8K377 Matn2-205ENSMUST00000227759 3569 ntAPPRIS ALT2 BASIC10□□□□□ -0.81
Lrrtm1Q8K377 Ncor2-202ENSMUST00000086083 8575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
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