Protein–RNA interactions for Protein: Q61657

Hes3, Transcription factor HES-3, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hes3Q61657 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Hes3Q61657 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Hes3Q61657 Zmat1-201ENSMUST00000064659 3501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Hes3Q61657 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Hes3Q61657 D930020B18Rik-201ENSMUST00000120642 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Hes3Q61657 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Hes3Q61657 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Hes3Q61657 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Hes3Q61657 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Hes3Q61657 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Hes3Q61657 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Hes3Q61657 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Hes3Q61657 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Hes3Q61657 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Hes3Q61657 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Hes3Q61657 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Hes3Q61657 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Hes3Q61657 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Hes3Q61657 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Hes3Q61657 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Hes3Q61657 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Hes3Q61657 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Hes3Q61657 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Hes3Q61657 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Hes3Q61657 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Hes3Q61657 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Hes3Q61657 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Hes3Q61657 Mroh8-202ENSMUST00000143663 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Hes3Q61657 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Hes3Q61657 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Hes3Q61657 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Hes3Q61657 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Hes3Q61657 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Hes3Q61657 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Hes3Q61657 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Hes3Q61657 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Hes3Q61657 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Hes3Q61657 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Hes3Q61657 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Hes3Q61657 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Hes3Q61657 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Hes3Q61657 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Hes3Q61657 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Hes3Q61657 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Hes3Q61657 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Hes3Q61657 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Hes3Q61657 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Hes3Q61657 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Hes3Q61657 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Hes3Q61657 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Hes3Q61657 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Hes3Q61657 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Hes3Q61657 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Hes3Q61657 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Hes3Q61657 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Hes3Q61657 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Hes3Q61657 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Hes3Q61657 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Hes3Q61657 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Hes3Q61657 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Hes3Q61657 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Hes3Q61657 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Hes3Q61657 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Hes3Q61657 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Hes3Q61657 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Hes3Q61657 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Hes3Q61657 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Hes3Q61657 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Hes3Q61657 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Hes3Q61657 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Hes3Q61657 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Hes3Q61657 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Hes3Q61657 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Hes3Q61657 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Hes3Q61657 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Hes3Q61657 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Hes3Q61657 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Hes3Q61657 Fmnl1-207ENSMUST00000218163 3824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Hes3Q61657 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Hes3Q61657 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Hes3Q61657 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Hes3Q61657 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Hes3Q61657 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Hes3Q61657 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Hes3Q61657 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Hes3Q61657 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Hes3Q61657 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Hes3Q61657 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Hes3Q61657 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Hes3Q61657 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Hes3Q61657 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Hes3Q61657 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Hes3Q61657 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Hes3Q61657 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Hes3Q61657 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Hes3Q61657 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Hes3Q61657 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Hes3Q61657 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Hes3Q61657 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Hes3Q61657 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.1 ms