Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0L5

Lrrc43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc43Q3V0L5 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Lrrc43Q3V0L5 Olfr180-201ENSMUST00000171656 1154 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Lrrc43Q3V0L5 Gm26723-201ENSMUST00000180771 787 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Lrrc43Q3V0L5 Rrh-205ENSMUST00000196902 1250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lrrc43Q3V0L5 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Lrrc43Q3V0L5 Rnf212-206ENSMUST00000212212 924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Lrrc43Q3V0L5 AC154594.1-201ENSMUST00000225171 1273 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Lrrc43Q3V0L5 AC154627.1-201ENSMUST00000228799 1286 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Lrrc43Q3V0L5 Commd4-201ENSMUST00000065358 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lrrc43Q3V0L5 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lrrc43Q3V0L5 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Lrrc43Q3V0L5 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Lrrc43Q3V0L5 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lrrc43Q3V0L5 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lrrc43Q3V0L5 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Lrrc43Q3V0L5 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Lrrc43Q3V0L5 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Lrrc43Q3V0L5 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lrrc43Q3V0L5 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lrrc43Q3V0L5 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lrrc43Q3V0L5 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lrrc43Q3V0L5 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Lrrc43Q3V0L5 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Lrrc43Q3V0L5 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lrrc43Q3V0L5 Gm26724-201ENSMUST00000180434 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lrrc43Q3V0L5 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lrrc43Q3V0L5 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lrrc43Q3V0L5 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lrrc43Q3V0L5 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lrrc43Q3V0L5 AC153524.2-201ENSMUST00000218351 1375 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lrrc43Q3V0L5 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Lrrc43Q3V0L5 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lrrc43Q3V0L5 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lrrc43Q3V0L5 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lrrc43Q3V0L5 Kcne3-203ENSMUST00000178946 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lrrc43Q3V0L5 Aurkc-203ENSMUST00000207711 1320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lrrc43Q3V0L5 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lrrc43Q3V0L5 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lrrc43Q3V0L5 Ighv7-2-201ENSMUST00000103462 354 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lrrc43Q3V0L5 Ywhaq-ps2-201ENSMUST00000117738 643 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Lrrc43Q3V0L5 Gm14480-201ENSMUST00000118521 433 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Lrrc43Q3V0L5 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lrrc43Q3V0L5 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lrrc43Q3V0L5 Gm14617-201ENSMUST00000128053 798 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lrrc43Q3V0L5 Gm13206-201ENSMUST00000129579 1090 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lrrc43Q3V0L5 Vmn1r-ps56-201ENSMUST00000172769 965 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Lrrc43Q3V0L5 Gm16958-202ENSMUST00000181792 830 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lrrc43Q3V0L5 Gm29277-201ENSMUST00000185226 602 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lrrc43Q3V0L5 Ly6e-203ENSMUST00000185861 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lrrc43Q3V0L5 Gm29089-201ENSMUST00000186209 602 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lrrc43Q3V0L5 Gm7891-201ENSMUST00000190284 843 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Lrrc43Q3V0L5 Gm37406-201ENSMUST00000192478 500 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lrrc43Q3V0L5 Gm43539-201ENSMUST00000196190 363 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lrrc43Q3V0L5 Gm42640-201ENSMUST00000199792 1195 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Lrrc43Q3V0L5 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lrrc43Q3V0L5 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lrrc43Q3V0L5 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lrrc43Q3V0L5 1700051K13Rik-201ENSMUST00000204426 696 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Lrrc43Q3V0L5 Gm45594-201ENSMUST00000211717 241 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Lrrc43Q3V0L5 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lrrc43Q3V0L5 Olfr1093-201ENSMUST00000055273 969 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lrrc43Q3V0L5 Olfr1472-201ENSMUST00000077501 945 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lrrc43Q3V0L5 Olfr1475-201ENSMUST00000080801 945 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lrrc43Q3V0L5 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lrrc43Q3V0L5 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lrrc43Q3V0L5 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lrrc43Q3V0L5 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lrrc43Q3V0L5 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lrrc43Q3V0L5 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lrrc43Q3V0L5 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lrrc43Q3V0L5 Gm9929-201ENSMUST00000171747 1671 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lrrc43Q3V0L5 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lrrc43Q3V0L5 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lrrc43Q3V0L5 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lrrc43Q3V0L5 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lrrc43Q3V0L5 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lrrc43Q3V0L5 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lrrc43Q3V0L5 Gm37859-201ENSMUST00000195529 2173 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Lrrc43Q3V0L5 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lrrc43Q3V0L5 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lrrc43Q3V0L5 Gm19967-201ENSMUST00000179676 2138 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lrrc43Q3V0L5 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lrrc43Q3V0L5 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lrrc43Q3V0L5 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lrrc43Q3V0L5 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lrrc43Q3V0L5 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lrrc43Q3V0L5 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lrrc43Q3V0L5 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lrrc43Q3V0L5 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lrrc43Q3V0L5 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lrrc43Q3V0L5 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lrrc43Q3V0L5 Chil6-201ENSMUST00000029510 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lrrc43Q3V0L5 Trim12a-203ENSMUST00000106839 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lrrc43Q3V0L5 Sp3os-203ENSMUST00000137941 628 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lrrc43Q3V0L5 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lrrc43Q3V0L5 Gm24398-201ENSMUST00000157870 109 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Lrrc43Q3V0L5 Taf1d-202ENSMUST00000164079 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lrrc43Q3V0L5 4930405O22Rik-201ENSMUST00000164605 954 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lrrc43Q3V0L5 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lrrc43Q3V0L5 Gm22877-201ENSMUST00000175451 105 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.2 ms