Protein–RNA interactions for Protein: Q03517

Scg2, Secretogranin-2, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scg2Q03517 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Scg2Q03517 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Scg2Q03517 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Scg2Q03517 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Scg2Q03517 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Scg2Q03517 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Scg2Q03517 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Scg2Q03517 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Scg2Q03517 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Scg2Q03517 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Scg2Q03517 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Scg2Q03517 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Scg2Q03517 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Scg2Q03517 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Scg2Q03517 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Scg2Q03517 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Scg2Q03517 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Scg2Q03517 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Scg2Q03517 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Scg2Q03517 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Scg2Q03517 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Scg2Q03517 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Scg2Q03517 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Scg2Q03517 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Scg2Q03517 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Scg2Q03517 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Scg2Q03517 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Scg2Q03517 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Scg2Q03517 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Scg2Q03517 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Scg2Q03517 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Scg2Q03517 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Scg2Q03517 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Scg2Q03517 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Scg2Q03517 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Scg2Q03517 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Scg2Q03517 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Scg2Q03517 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Scg2Q03517 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Scg2Q03517 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Scg2Q03517 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Scg2Q03517 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Scg2Q03517 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Scg2Q03517 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Scg2Q03517 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Scg2Q03517 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Scg2Q03517 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Scg2Q03517 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Scg2Q03517 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Scg2Q03517 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Scg2Q03517 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Scg2Q03517 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Scg2Q03517 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Scg2Q03517 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Scg2Q03517 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Scg2Q03517 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Scg2Q03517 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Scg2Q03517 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Scg2Q03517 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Scg2Q03517 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Scg2Q03517 Gm12856-201ENSMUST00000119471 1293 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Scg2Q03517 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Scg2Q03517 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Scg2Q03517 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Scg2Q03517 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Scg2Q03517 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Scg2Q03517 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Scg2Q03517 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Scg2Q03517 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Scg2Q03517 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Scg2Q03517 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Scg2Q03517 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Scg2Q03517 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Scg2Q03517 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Scg2Q03517 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Scg2Q03517 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Scg2Q03517 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Scg2Q03517 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Scg2Q03517 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Scg2Q03517 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Scg2Q03517 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Scg2Q03517 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Scg2Q03517 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Scg2Q03517 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Scg2Q03517 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Scg2Q03517 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Scg2Q03517 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Scg2Q03517 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Scg2Q03517 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Scg2Q03517 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Scg2Q03517 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Scg2Q03517 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Scg2Q03517 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Scg2Q03517 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Scg2Q03517 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Scg2Q03517 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Scg2Q03517 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Scg2Q03517 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Scg2Q03517 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Scg2Q03517 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.5 ms