Protein–RNA interactions for Protein: Q00623

Apoa1, Apolipoprotein A-I, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa1Q00623 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Col11a1-201ENSMUST00000092155 7667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Ddah1-202ENSMUST00000120310 2291 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Cmya5-201ENSMUST00000062122 11850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Pcdha6-201ENSMUST00000193389 4653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Gm26660-202ENSMUST00000223620 4112 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Nfx1-203ENSMUST00000098143 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Cacna2d4-201ENSMUST00000037434 5803 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Fcgbp-203ENSMUST00000138392 7926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Fcgbp-201ENSMUST00000076648 7928 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Kcns2-202ENSMUST00000228725 4906 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Cfap74-209ENSMUST00000151083 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Ndor1-201ENSMUST00000100329 4517 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Slc6a2-201ENSMUST00000072939 6187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Zbtb21-203ENSMUST00000113734 6010 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Mamld1-201ENSMUST00000082088 4796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Phip-201ENSMUST00000034787 10756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Cit-201ENSMUST00000051704 9514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.6 ms