Protein–RNA interactions for Protein: P43117

Ptgfr, Prostaglandin F2-alpha receptor, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtgfrP43117 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PtgfrP43117 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
PtgfrP43117 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
PtgfrP43117 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PtgfrP43117 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PtgfrP43117 Gm30648-202ENSMUST00000200648 1957 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PtgfrP43117 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
PtgfrP43117 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PtgfrP43117 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PtgfrP43117 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
PtgfrP43117 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
PtgfrP43117 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PtgfrP43117 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
PtgfrP43117 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PtgfrP43117 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
PtgfrP43117 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
PtgfrP43117 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PtgfrP43117 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
PtgfrP43117 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PtgfrP43117 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
PtgfrP43117 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
PtgfrP43117 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
PtgfrP43117 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
PtgfrP43117 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
PtgfrP43117 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
PtgfrP43117 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
PtgfrP43117 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PtgfrP43117 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
PtgfrP43117 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PtgfrP43117 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
PtgfrP43117 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PtgfrP43117 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
PtgfrP43117 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
PtgfrP43117 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
PtgfrP43117 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PtgfrP43117 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PtgfrP43117 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PtgfrP43117 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PtgfrP43117 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PtgfrP43117 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PtgfrP43117 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PtgfrP43117 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
PtgfrP43117 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PtgfrP43117 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PtgfrP43117 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PtgfrP43117 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PtgfrP43117 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
PtgfrP43117 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PtgfrP43117 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PtgfrP43117 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PtgfrP43117 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PtgfrP43117 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PtgfrP43117 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PtgfrP43117 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PtgfrP43117 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PtgfrP43117 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PtgfrP43117 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
PtgfrP43117 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PtgfrP43117 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PtgfrP43117 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PtgfrP43117 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PtgfrP43117 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
PtgfrP43117 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PtgfrP43117 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
PtgfrP43117 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PtgfrP43117 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
PtgfrP43117 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
PtgfrP43117 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
PtgfrP43117 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
PtgfrP43117 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
PtgfrP43117 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
PtgfrP43117 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
PtgfrP43117 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
PtgfrP43117 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
PtgfrP43117 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
PtgfrP43117 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
PtgfrP43117 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
PtgfrP43117 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
PtgfrP43117 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
PtgfrP43117 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
PtgfrP43117 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
PtgfrP43117 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
PtgfrP43117 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
PtgfrP43117 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
PtgfrP43117 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
PtgfrP43117 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
PtgfrP43117 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
PtgfrP43117 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
PtgfrP43117 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
PtgfrP43117 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
PtgfrP43117 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
PtgfrP43117 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
PtgfrP43117 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
PtgfrP43117 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
PtgfrP43117 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
PtgfrP43117 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
PtgfrP43117 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
PtgfrP43117 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
PtgfrP43117 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
PtgfrP43117 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.4 ms