Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Q1

Ribc2, RIB43A-like with coiled-coils protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ribc2Q9D4Q1 Nxpe5-204ENSMUST00000161047 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ribc2Q9D4Q1 Usp2-203ENSMUST00000114830 2122 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ribc2Q9D4Q1 Cpne9-201ENSMUST00000041203 2777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ribc2Q9D4Q1 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ribc2Q9D4Q1 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ribc2Q9D4Q1 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ribc2Q9D4Q1 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ribc2Q9D4Q1 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ribc2Q9D4Q1 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ribc2Q9D4Q1 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ribc2Q9D4Q1 Acot9-201ENSMUST00000026324 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ribc2Q9D4Q1 Arhgef4-204ENSMUST00000159747 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ribc2Q9D4Q1 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ribc2Q9D4Q1 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ribc2Q9D4Q1 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ribc2Q9D4Q1 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ribc2Q9D4Q1 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Ribc2Q9D4Q1 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ribc2Q9D4Q1 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Ribc2Q9D4Q1 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Ribc2Q9D4Q1 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Ribc2Q9D4Q1 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ribc2Q9D4Q1 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Ribc2Q9D4Q1 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ribc2Q9D4Q1 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ribc2Q9D4Q1 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ribc2Q9D4Q1 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ribc2Q9D4Q1 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ribc2Q9D4Q1 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ribc2Q9D4Q1 Ugt1a10-201ENSMUST00000113142 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ribc2Q9D4Q1 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ribc2Q9D4Q1 Dclk2-202ENSMUST00000191752 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ribc2Q9D4Q1 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ribc2Q9D4Q1 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ribc2Q9D4Q1 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ribc2Q9D4Q1 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ribc2Q9D4Q1 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Ribc2Q9D4Q1 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ribc2Q9D4Q1 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ribc2Q9D4Q1 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ribc2Q9D4Q1 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ribc2Q9D4Q1 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ribc2Q9D4Q1 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ribc2Q9D4Q1 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ribc2Q9D4Q1 Tas1r2-202ENSMUST00000166773 2524 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ribc2Q9D4Q1 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ribc2Q9D4Q1 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ribc2Q9D4Q1 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ribc2Q9D4Q1 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ribc2Q9D4Q1 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ribc2Q9D4Q1 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ribc2Q9D4Q1 Arpc3-202ENSMUST00000102525 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ribc2Q9D4Q1 Mpl-202ENSMUST00000102671 2934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ribc2Q9D4Q1 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Ribc2Q9D4Q1 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ribc2Q9D4Q1 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Ribc2Q9D4Q1 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Ribc2Q9D4Q1 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Ribc2Q9D4Q1 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Ribc2Q9D4Q1 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ribc2Q9D4Q1 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ribc2Q9D4Q1 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ribc2Q9D4Q1 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ribc2Q9D4Q1 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Ribc2Q9D4Q1 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Ribc2Q9D4Q1 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Ribc2Q9D4Q1 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Ribc2Q9D4Q1 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
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Ribc2Q9D4Q1 Eif3a-201ENSMUST00000025955 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ribc2Q9D4Q1 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ribc2Q9D4Q1 Tmem109-201ENSMUST00000038128 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ribc2Q9D4Q1 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ribc2Q9D4Q1 Psd4-201ENSMUST00000056641 4748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ribc2Q9D4Q1 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ribc2Q9D4Q1 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ribc2Q9D4Q1 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ribc2Q9D4Q1 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ribc2Q9D4Q1 Gphb5-201ENSMUST00000051079 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ribc2Q9D4Q1 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ribc2Q9D4Q1 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ribc2Q9D4Q1 Pex13-201ENSMUST00000020523 4146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ribc2Q9D4Q1 Mageb4-202ENSMUST00000113969 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ribc2Q9D4Q1 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ribc2Q9D4Q1 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ribc2Q9D4Q1 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ribc2Q9D4Q1 Chil1-207ENSMUST00000153856 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ribc2Q9D4Q1 Gm10912-201ENSMUST00000104891 1661 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ribc2Q9D4Q1 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ribc2Q9D4Q1 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ribc2Q9D4Q1 A1cf-202ENSMUST00000224304 2968 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ribc2Q9D4Q1 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ribc2Q9D4Q1 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ribc2Q9D4Q1 Fmnl1-207ENSMUST00000218163 3824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ribc2Q9D4Q1 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ribc2Q9D4Q1 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ribc2Q9D4Q1 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
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Ribc2Q9D4Q1 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
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