Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSN2

Clm, CMRF35-like molecule, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClmQ7TSN2 4930432L08Rik-201ENSMUST00000132154 1608 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
ClmQ7TSN2 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
ClmQ7TSN2 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
ClmQ7TSN2 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
ClmQ7TSN2 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
ClmQ7TSN2 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
ClmQ7TSN2 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
ClmQ7TSN2 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
ClmQ7TSN2 Rasgef1a-203ENSMUST00000203804 2183 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
ClmQ7TSN2 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
ClmQ7TSN2 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
ClmQ7TSN2 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
ClmQ7TSN2 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
ClmQ7TSN2 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
ClmQ7TSN2 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
ClmQ7TSN2 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
ClmQ7TSN2 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
ClmQ7TSN2 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
ClmQ7TSN2 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
ClmQ7TSN2 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
ClmQ7TSN2 Tmprss2-201ENSMUST00000000395 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
ClmQ7TSN2 Gm37891-201ENSMUST00000195585 1326 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
ClmQ7TSN2 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
ClmQ7TSN2 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
ClmQ7TSN2 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
ClmQ7TSN2 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
ClmQ7TSN2 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
ClmQ7TSN2 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
ClmQ7TSN2 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
ClmQ7TSN2 Gm6710-201ENSMUST00000109011 1445 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
ClmQ7TSN2 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
ClmQ7TSN2 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
ClmQ7TSN2 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
ClmQ7TSN2 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
ClmQ7TSN2 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
ClmQ7TSN2 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
ClmQ7TSN2 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
ClmQ7TSN2 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
ClmQ7TSN2 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
ClmQ7TSN2 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
ClmQ7TSN2 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
ClmQ7TSN2 Trbv3-201ENSMUST00000103264 455 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
ClmQ7TSN2 Ighv7-1-201ENSMUST00000103474 363 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
ClmQ7TSN2 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
ClmQ7TSN2 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
ClmQ7TSN2 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
ClmQ7TSN2 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
ClmQ7TSN2 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
ClmQ7TSN2 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
ClmQ7TSN2 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
ClmQ7TSN2 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
ClmQ7TSN2 Vmn1r10-201ENSMUST00000176073 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
ClmQ7TSN2 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
ClmQ7TSN2 1810022K09Rik-204ENSMUST00000186870 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
ClmQ7TSN2 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
ClmQ7TSN2 Gm38177-201ENSMUST00000192213 1040 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
ClmQ7TSN2 Gm6119-201ENSMUST00000193443 1206 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
ClmQ7TSN2 Gm4430-202ENSMUST00000193902 1041 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
ClmQ7TSN2 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
ClmQ7TSN2 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
ClmQ7TSN2 Gm10688-201ENSMUST00000214985 520 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
ClmQ7TSN2 AC153516.1-201ENSMUST00000217955 779 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
ClmQ7TSN2 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
ClmQ7TSN2 Olfr843-201ENSMUST00000061365 1107 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
ClmQ7TSN2 Vmn1r232-201ENSMUST00000077001 1159 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
ClmQ7TSN2 Vmn1r201-201ENSMUST00000091730 903 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
ClmQ7TSN2 Gm23058-201ENSMUST00000093703 107 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
ClmQ7TSN2 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
ClmQ7TSN2 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
ClmQ7TSN2 Gm42736-201ENSMUST00000200723 1353 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
ClmQ7TSN2 Zfp780b-203ENSMUST00000205874 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
ClmQ7TSN2 Tmigd1-201ENSMUST00000072633 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
ClmQ7TSN2 Olfr239-202ENSMUST00000213731 3690 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
ClmQ7TSN2 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
ClmQ7TSN2 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
ClmQ7TSN2 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
ClmQ7TSN2 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
ClmQ7TSN2 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
ClmQ7TSN2 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
ClmQ7TSN2 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
ClmQ7TSN2 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
ClmQ7TSN2 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
ClmQ7TSN2 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
ClmQ7TSN2 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
ClmQ7TSN2 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
ClmQ7TSN2 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
ClmQ7TSN2 Gm28240-201ENSMUST00000187560 2053 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
ClmQ7TSN2 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
ClmQ7TSN2 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
ClmQ7TSN2 Lrriq3-203ENSMUST00000194376 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
ClmQ7TSN2 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
ClmQ7TSN2 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
ClmQ7TSN2 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
ClmQ7TSN2 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
ClmQ7TSN2 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
ClmQ7TSN2 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
ClmQ7TSN2 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
ClmQ7TSN2 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
ClmQ7TSN2 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
ClmQ7TSN2 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.6 ms