Protein–RNA interactions for Protein: Q08093

Cnn2, Calponin-2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn2Q08093 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cnn2Q08093 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cnn2Q08093 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cnn2Q08093 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cnn2Q08093 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cnn2Q08093 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cnn2Q08093 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cnn2Q08093 Syt11-203ENSMUST00000107505 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cnn2Q08093 Il6st-201ENSMUST00000070731 5207 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cnn2Q08093 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cnn2Q08093 Tnc-203ENSMUST00000107372 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cnn2Q08093 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cnn2Q08093 Myo1h-210ENSMUST00000202006 4631 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cnn2Q08093 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Cnn2Q08093 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cnn2Q08093 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Cnn2Q08093 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cnn2Q08093 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cnn2Q08093 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cnn2Q08093 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cnn2Q08093 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cnn2Q08093 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cnn2Q08093 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cnn2Q08093 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cnn2Q08093 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cnn2Q08093 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cnn2Q08093 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cnn2Q08093 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cnn2Q08093 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cnn2Q08093 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cnn2Q08093 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cnn2Q08093 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cnn2Q08093 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cnn2Q08093 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cnn2Q08093 Pkp4-201ENSMUST00000037903 4378 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cnn2Q08093 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cnn2Q08093 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Cnn2Q08093 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cnn2Q08093 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cnn2Q08093 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Cnn2Q08093 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cnn2Q08093 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cnn2Q08093 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cnn2Q08093 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cnn2Q08093 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cnn2Q08093 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cnn2Q08093 Cit-201ENSMUST00000051704 9514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cnn2Q08093 Mtf1-202ENSMUST00000106193 7554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cnn2Q08093 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cnn2Q08093 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cnn2Q08093 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cnn2Q08093 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cnn2Q08093 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cnn2Q08093 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cnn2Q08093 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Cnn2Q08093 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cnn2Q08093 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Cnn2Q08093 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cnn2Q08093 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cnn2Q08093 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cnn2Q08093 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cnn2Q08093 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cnn2Q08093 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cnn2Q08093 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Cnn2Q08093 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Cnn2Q08093 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Cnn2Q08093 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cnn2Q08093 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Cnn2Q08093 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cnn2Q08093 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Cnn2Q08093 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cnn2Q08093 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cnn2Q08093 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cnn2Q08093 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cnn2Q08093 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cnn2Q08093 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Cnn2Q08093 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cnn2Q08093 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cnn2Q08093 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Cnn2Q08093 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cnn2Q08093 Spice1-201ENSMUST00000050897 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cnn2Q08093 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cnn2Q08093 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cnn2Q08093 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cnn2Q08093 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cnn2Q08093 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cnn2Q08093 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cnn2Q08093 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cnn2Q08093 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cnn2Q08093 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cnn2Q08093 Tmod2-202ENSMUST00000098552 9871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cnn2Q08093 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cnn2Q08093 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cnn2Q08093 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cnn2Q08093 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cnn2Q08093 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cnn2Q08093 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cnn2Q08093 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cnn2Q08093 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cnn2Q08093 Pdp2-201ENSMUST00000059588 5692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms