Protein–RNA interactions for Protein: Q03350

Thbs2, Thrombospondin-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs2Q03350 Flad1-204ENSMUST00000129308 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Thbs2Q03350 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Thbs2Q03350 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Thbs2Q03350 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Thbs2Q03350 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Thbs2Q03350 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Thbs2Q03350 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Thbs2Q03350 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Thbs2Q03350 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Thbs2Q03350 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Thbs2Q03350 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Thbs2Q03350 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Thbs2Q03350 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Thbs2Q03350 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Thbs2Q03350 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Thbs2Q03350 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Thbs2Q03350 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Thbs2Q03350 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Thbs2Q03350 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Thbs2Q03350 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Thbs2Q03350 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Thbs2Q03350 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Thbs2Q03350 Slc22a14-201ENSMUST00000093775 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Thbs2Q03350 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Thbs2Q03350 Ccdc162-212ENSMUST00000219054 3182 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Thbs2Q03350 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Thbs2Q03350 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Thbs2Q03350 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Thbs2Q03350 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Thbs2Q03350 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Thbs2Q03350 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Thbs2Q03350 C2cd5-213ENSMUST00000204655 3526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Thbs2Q03350 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Thbs2Q03350 Sord-201ENSMUST00000110551 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Thbs2Q03350 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Thbs2Q03350 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Thbs2Q03350 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Thbs2Q03350 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Thbs2Q03350 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Thbs2Q03350 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Thbs2Q03350 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Thbs2Q03350 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Thbs2Q03350 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Thbs2Q03350 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Thbs2Q03350 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Thbs2Q03350 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Thbs2Q03350 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Thbs2Q03350 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Thbs2Q03350 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Thbs2Q03350 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Thbs2Q03350 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Thbs2Q03350 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Thbs2Q03350 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Thbs2Q03350 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Thbs2Q03350 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Thbs2Q03350 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Thbs2Q03350 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Thbs2Q03350 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Thbs2Q03350 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Thbs2Q03350 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Thbs2Q03350 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Thbs2Q03350 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Thbs2Q03350 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Thbs2Q03350 Gm43936-201ENSMUST00000203987 490 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Thbs2Q03350 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Thbs2Q03350 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Thbs2Q03350 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Thbs2Q03350 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Thbs2Q03350 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Thbs2Q03350 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Thbs2Q03350 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Thbs2Q03350 Prr9-201ENSMUST00000070284 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Thbs2Q03350 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Thbs2Q03350 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Thbs2Q03350 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Thbs2Q03350 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Thbs2Q03350 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Thbs2Q03350 Rgs12-203ENSMUST00000114280 2777 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Thbs2Q03350 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Thbs2Q03350 Atl2-202ENSMUST00000112437 3371 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Thbs2Q03350 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Thbs2Q03350 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Thbs2Q03350 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Thbs2Q03350 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Thbs2Q03350 Col6a4-201ENSMUST00000121963 7371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Thbs2Q03350 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Thbs2Q03350 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Thbs2Q03350 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Thbs2Q03350 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Thbs2Q03350 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Thbs2Q03350 Gm19299-202ENSMUST00000215724 1435 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Thbs2Q03350 Gm21986-201ENSMUST00000113671 5560 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Thbs2Q03350 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Thbs2Q03350 Pou1f1-201ENSMUST00000004964 1773 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Thbs2Q03350 Odf2l-204ENSMUST00000106192 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Thbs2Q03350 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Thbs2Q03350 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Thbs2Q03350 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Thbs2Q03350 4732491K20Rik-201ENSMUST00000181774 3142 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Thbs2Q03350 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms