Protein–RNA interactions for Protein: P83940

Eloc, Elongin-C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ElocP83940 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ElocP83940 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ElocP83940 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ElocP83940 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ElocP83940 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ElocP83940 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ElocP83940 Gm14236-201ENSMUST00000142374 872 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ElocP83940 Gm22442-201ENSMUST00000157256 144 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
ElocP83940 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
ElocP83940 Gm27232-201ENSMUST00000184373 597 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
ElocP83940 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
ElocP83940 Olfr567-ps1-201ENSMUST00000210349 857 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
ElocP83940 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ElocP83940 Tbca-201ENSMUST00000046644 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ElocP83940 Cmbl-201ENSMUST00000070918 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ElocP83940 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
ElocP83940 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
ElocP83940 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ElocP83940 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
ElocP83940 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
ElocP83940 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ElocP83940 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
ElocP83940 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ElocP83940 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
ElocP83940 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ElocP83940 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ElocP83940 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ElocP83940 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
ElocP83940 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ElocP83940 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
ElocP83940 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ElocP83940 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
ElocP83940 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ElocP83940 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ElocP83940 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ElocP83940 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ElocP83940 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ElocP83940 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ElocP83940 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ElocP83940 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ElocP83940 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ElocP83940 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ElocP83940 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
ElocP83940 Rsrc1-206ENSMUST00000162036 1406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
ElocP83940 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ElocP83940 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ElocP83940 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ElocP83940 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ElocP83940 Ighv1-61-201ENSMUST00000103531 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
ElocP83940 Gm26013-201ENSMUST00000104404 119 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
ElocP83940 Tprkb-203ENSMUST00000113751 692 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ElocP83940 Gm12795-201ENSMUST00000117594 539 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
ElocP83940 Gm15615-201ENSMUST00000118876 198 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
ElocP83940 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ElocP83940 Adap2os-201ENSMUST00000140556 984 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
ElocP83940 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ElocP83940 Gm25072-201ENSMUST00000175233 235 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
ElocP83940 Gm7137-201ENSMUST00000180161 711 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
ElocP83940 Gm7741-201ENSMUST00000181445 989 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
ElocP83940 Gm37406-201ENSMUST00000192478 500 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
ElocP83940 Gm44315-201ENSMUST00000203041 219 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
ElocP83940 Chn2-212ENSMUST00000204115 783 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
ElocP83940 AC159462.1-201ENSMUST00000214822 687 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
ElocP83940 Gm3285-201ENSMUST00000218443 908 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
ElocP83940 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
ElocP83940 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ElocP83940 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
ElocP83940 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ElocP83940 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
ElocP83940 Olfr584-201ENSMUST00000098210 964 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
ElocP83940 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ElocP83940 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ElocP83940 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ElocP83940 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
ElocP83940 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ElocP83940 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ElocP83940 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
ElocP83940 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
ElocP83940 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ElocP83940 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
ElocP83940 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
ElocP83940 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
ElocP83940 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
ElocP83940 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
ElocP83940 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
ElocP83940 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
ElocP83940 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
ElocP83940 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
ElocP83940 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
ElocP83940 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
ElocP83940 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
ElocP83940 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
ElocP83940 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
ElocP83940 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
ElocP83940 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
ElocP83940 Gm23272-201ENSMUST00000104053 129 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
ElocP83940 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
ElocP83940 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
ElocP83940 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
ElocP83940 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms