Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hoxd13P70217 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hoxd13P70217 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hoxd13P70217 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hoxd13P70217 Catsper3-201ENSMUST00000021961 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hoxd13P70217 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxd13P70217 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxd13P70217 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxd13P70217 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxd13P70217 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxd13P70217 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxd13P70217 A530032D15Rik-201ENSMUST00000160792 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxd13P70217 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxd13P70217 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxd13P70217 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxd13P70217 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxd13P70217 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxd13P70217 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxd13P70217 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxd13P70217 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxd13P70217 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxd13P70217 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxd13P70217 Ighv5-9-201ENSMUST00000103448 418 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxd13P70217 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxd13P70217 Hist1h2bk-201ENSMUST00000110455 476 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxd13P70217 1600010M07Rik-202ENSMUST00000188662 654 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxd13P70217 Gm7271-202ENSMUST00000191515 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxd13P70217 Nras-208ENSMUST00000200069 831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxd13P70217 1700012D14Rik-204ENSMUST00000210788 547 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxd13P70217 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxd13P70217 AC154826.1-201ENSMUST00000217369 498 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxd13P70217 CT030653.1-201ENSMUST00000224382 1279 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxd13P70217 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxd13P70217 Gm2174-201ENSMUST00000079663 402 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxd13P70217 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxd13P70217 Brd4-202ENSMUST00000114475 2731 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxd13P70217 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxd13P70217 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxd13P70217 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxd13P70217 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxd13P70217 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxd13P70217 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxd13P70217 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxd13P70217 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxd13P70217 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxd13P70217 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxd13P70217 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxd13P70217 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxd13P70217 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxd13P70217 Clec4a3-201ENSMUST00000088468 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxd13P70217 Ecsit-204ENSMUST00000180180 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxd13P70217 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxd13P70217 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxd13P70217 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxd13P70217 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxd13P70217 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxd13P70217 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxd13P70217 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxd13P70217 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxd13P70217 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxd13P70217 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxd13P70217 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxd13P70217 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxd13P70217 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxd13P70217 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Hoxd13P70217 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxd13P70217 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxd13P70217 Gm11422-201ENSMUST00000118925 1103 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
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Hoxd13P70217 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Hoxd13P70217 Gm42816-201ENSMUST00000198433 325 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxd13P70217 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxd13P70217 Gm18059-201ENSMUST00000208073 580 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxd13P70217 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxd13P70217 Gm45570-201ENSMUST00000211137 495 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxd13P70217 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxd13P70217 Gm18856-203ENSMUST00000222015 483 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxd13P70217 CT030170.2-201ENSMUST00000223267 126 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxd13P70217 Ap3s1-202ENSMUST00000224622 978 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxd13P70217 AC129308.3-201ENSMUST00000225652 524 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxd13P70217 Higd2a-201ENSMUST00000026986 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxd13P70217 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxd13P70217 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxd13P70217 1700001K19Rik-201ENSMUST00000070659 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxd13P70217 Gm4744-201ENSMUST00000073642 792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxd13P70217 Uba52-201ENSMUST00000081940 541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxd13P70217 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxd13P70217 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxd13P70217 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxd13P70217 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxd13P70217 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxd13P70217 Dclk1-215ENSMUST00000200352 1662 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxd13P70217 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxd13P70217 Abcg2-202ENSMUST00000114294 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxd13P70217 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxd13P70217 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxd13P70217 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
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